46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5166 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 289 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  56.54 
 
 		 289 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  48.42 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  46.32 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.24 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  38.63 
 
 		 717 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  38.63 
 
 		 717 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  37.91 
 
 		 717 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  40.07 
 
 		 266 aa  165  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  38.43 
 
 		 263 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  37.31 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  38.2 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  31.9 
 
 		 746 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  39.23 
 
 		 183 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  45.21 
 
 		 749 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  33.2 
 
 		 746 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  33.2 
 
 		 746 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.76 
 
 		 206 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  28.99 
 
 		 255 aa  92.4  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.51 
 
 		 599 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.76 
 
 		 970 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  32.49 
 
 		 955 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.5 
 
 		 970 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.78 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.36 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  37.24 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  40 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  30.47 
 
 		 667 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  35.19 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  35.81 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  35.22 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.27 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.31 
 
 		 1002 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.38 
 
 		 1006 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  32.9 
 
 		 756 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  33.12 
 
 		 158 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  32.97 
 
 		 102 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  31.17 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  34.62 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.67 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.74 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  27.72 
 
 		 213 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0820  phage related protein  41.27 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.109837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  30 
 
 		 692 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.91 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  27.47 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>