92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5094 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  68 
 
 		 1047 aa  1301    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  64.42 
 
 		 1040 aa  1144    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  66.54 
 
 		 1045 aa  1270    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 		 1054 aa  2038    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  66.06 
 
 		 1037 aa  1214    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  67.81 
 
 		 1047 aa  1297    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  43.65 
 
 		 1043 aa  668    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  40.16 
 
 		 1076 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  44.65 
 
 		 1015 aa  595  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  39.65 
 
 		 1048 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  40.57 
 
 		 1049 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  39.46 
 
 		 1049 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  40.99 
 
 		 1048 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  39.79 
 
 		 1049 aa  562  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  40.26 
 
 		 1042 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  39.8 
 
 		 1053 aa  549  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  39.65 
 
 		 1042 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  38.02 
 
 		 1052 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  38.02 
 
 		 1052 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  38.21 
 
 		 1059 aa  522  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  38.94 
 
 		 1001 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  36.93 
 
 		 1064 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  34.84 
 
 		 1047 aa  508  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  37.3 
 
 		 1064 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  37.26 
 
 		 1062 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  37.98 
 
 		 1018 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  36.53 
 
 		 999 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1016 aa  396  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  36.68 
 
 		 1014 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  35.88 
 
 		 991 aa  365  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  33.21 
 
 		 977 aa  363  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  34.33 
 
 		 988 aa  335  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  32.71 
 
 		 986 aa  327  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  44.21 
 
 		 1052 aa  312  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  32.84 
 
 		 993 aa  307  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  33.83 
 
 		 991 aa  297  8e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  34.47 
 
 		 980 aa  289  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  34.34 
 
 		 959 aa  274  8.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  38.87 
 
 		 1000 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  20.39 
 
 		 914 aa  159  3e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.83 
 
 		 911 aa  158  4e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  20.41 
 
 		 890 aa  153  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  37.06 
 
 		 997 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  34.55 
 
 		 997 aa  148  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.57 
 
 		 958 aa  90.1  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.29 
 
 		 962 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  28.84 
 
 		 976 aa  82.4  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.71 
 
 		 957 aa  81.3  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  23.55 
 
 		 788 aa  78.2  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  23.26 
 
 		 788 aa  75.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.97 
 
 		 836 aa  75.1  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  24.31 
 
 		 779 aa  73.9  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  23.26 
 
 		 788 aa  74.3  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  27.1 
 
 		 947 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  26.13 
 
 		 951 aa  65.1  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  46.07 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  23.56 
 
 		 951 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  26.88 
 
 		 908 aa  63.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  20.89 
 
 		 911 aa  62.4  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  31.28 
 
 		 864 aa  60.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  28.81 
 
 		 855 aa  59.3  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  21.39 
 
 		 994 aa  58.9  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  33.15 
 
 		 846 aa  56.2  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.5 
 
 		 1066 aa  56.2  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.08 
 
 		 781 aa  53.5  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  32.8 
 
 		 1055 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  23.25 
 
 		 858 aa  50.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.27 
 
 		 1049 aa  50.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 1051 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 1051 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  26.4 
 
 		 1077 aa  49.7  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  24.77 
 
 		 997 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 1051 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  25.58 
 
 		 930 aa  49.3  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  22.93 
 
 		 858 aa  48.9  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  21.03 
 
 		 794 aa  48.5  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  20.56 
 
 		 968 aa  48.5  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  20.46 
 
 		 781 aa  48.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  30.83 
 
 		 1038 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  27.71 
 
 		 1094 aa  47.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  20.04 
 
 		 909 aa  47.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  34.01 
 
 		 311 aa  46.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  29.79 
 
 		 299 aa  46.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.24 
 
 		 915 aa  45.8  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  20.4 
 
 		 919 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  32.69 
 
 		 896 aa  45.8  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.47 
 
 		 984 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.32 
 
 		 1048 aa  45.8  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1100 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  25.95 
 
 		 990 aa  45.1  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.77 
 
 		 989 aa  44.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  29.5 
 
 		 333 aa  44.7  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>