More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5091 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5091  general substrate transporter  100 
 
 
435 aa  866    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6399  General substrate transporter  73.46 
 
 
431 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2273  general substrate transporter  72.71 
 
 
440 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979998  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  67.76 
 
 
437 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  67.87 
 
 
477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  66.51 
 
 
454 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1646  general substrate transporter  64.79 
 
 
439 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6015  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.83 
 
 
438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.898773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  65.43 
 
 
437 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1663  general substrate transporter  62.41 
 
 
425 aa  555  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6303  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.67 
 
 
438 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  63.15 
 
 
435 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3179  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  63.92 
 
 
431 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5624  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  67.07 
 
 
439 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.181082  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0748  citrate-proton symporter  65.76 
 
 
434 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93839 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6132  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.03 
 
 
440 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0845  citrate-proton symporter  65.76 
 
 
434 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0736  citrate-proton symporter  65.76 
 
 
434 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0796  citrate-proton symporter  65.76 
 
 
434 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0809  citrate-proton symporter  65.76 
 
 
434 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511471  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7138  citrate-proton symporter  65.68 
 
 
437 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.575895  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5880  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.16 
 
 
440 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  61.37 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5520  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  61.37 
 
 
432 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.112643 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  61.37 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0530  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  60.56 
 
 
431 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3167  citrate-proton symport  60.28 
 
 
433 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.905782  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6263  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  61.14 
 
 
431 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268636  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0543  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  60.09 
 
 
431 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4980  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  60.09 
 
 
431 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  62.14 
 
 
429 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0958  major facilitator superfamily citrate/H(+) symporter  62.29 
 
 
433 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646724  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3029  General substrate transporter  60.91 
 
 
433 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.07969  normal  0.0112235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  60.83 
 
 
431 aa  525  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6012  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  61.41 
 
 
432 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3336  citrate transporter  61.48 
 
 
433 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0721  general substrate transporter  59.07 
 
 
433 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0155857  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3510  citrate-proton symport  61.61 
 
 
430 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0855554  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  61.8 
 
 
433 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5623  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  61.56 
 
 
431 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6371  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  61.14 
 
 
431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3864  general substrate transporter  62.01 
 
 
430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  60.34 
 
 
433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  60.34 
 
 
437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  59.61 
 
 
431 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  61.74 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2370  general substrate transporter  58.84 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114747  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0891  general substrate transporter  57.96 
 
 
431 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1618  citrate-proten symporter  59.37 
 
 
431 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0903  general substrate transporter  58.88 
 
 
431 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289816  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0454  citrate-proten symporter  59.12 
 
 
431 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0971  citrate-proton symporter  59.12 
 
 
431 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.710178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1899  major facilitator transporter  61.59 
 
 
430 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00967745  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3016  citrate-proton symporter  59.12 
 
 
446 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0175  citrate-proton symporter  59.12 
 
 
431 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2908  citrate-proton symporter  59.12 
 
 
431 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566614  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2600  citrate-proton symporter  59.12 
 
 
431 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2968  citrate-proton symporter  59.12 
 
 
431 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6273  citrate transporter  62.02 
 
 
429 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318839  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02399  citrate carrier protein  60.49 
 
 
425 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1027  general substrate transporter  58.64 
 
 
431 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0548  general substrate transporter  58.64 
 
 
488 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0986  general substrate transporter  58.64 
 
 
431 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535486  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72280  citrate transporter  61.54 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1915  major facilitator superfamily metabolite(citrate)/H(+) symporter  55.21 
 
 
440 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2401  General substrate transporter  54.5 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  41.63 
 
 
427 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  40.79 
 
 
425 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
438 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  41.69 
 
 
499 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  41.18 
 
 
425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  41.18 
 
 
425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  41.18 
 
 
425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 
438 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.02 
 
 
425 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  41.42 
 
 
425 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  41.67 
 
 
425 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  41.67 
 
 
425 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 
443 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 
425 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  41.48 
 
 
425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
443 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  39.03 
 
 
461 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.29 
 
 
430 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  38.79 
 
 
440 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  38.79 
 
 
440 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  37.32 
 
 
440 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  38.71 
 
 
435 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  38.1 
 
 
430 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  38.1 
 
 
430 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  38.1 
 
 
430 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  38.1 
 
 
430 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  38.1 
 
 
430 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  38.1 
 
 
430 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  38.71 
 
 
435 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 
457 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  38.71 
 
 
417 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  38.5 
 
 
435 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  38.5 
 
 
435 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  35.97 
 
 
438 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>