42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4909 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  75.21 
 
 
244 aa  341  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  75.21 
 
 
243 aa  338  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  75.31 
 
 
245 aa  318  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  56.91 
 
 
247 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  55.51 
 
 
245 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  58.4 
 
 
247 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  51.46 
 
 
239 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  50.83 
 
 
239 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  54 
 
 
544 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  39.92 
 
 
249 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  32.05 
 
 
231 aa  164  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  35.78 
 
 
231 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  34.91 
 
 
231 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  34.91 
 
 
231 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  34.48 
 
 
231 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  40.52 
 
 
236 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  38.96 
 
 
248 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  39.5 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  35.32 
 
 
232 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  36.02 
 
 
230 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  32.05 
 
 
230 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  33.96 
 
 
246 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  26.51 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  33.99 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  45.54 
 
 
178 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  27.44 
 
 
338 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  28.71 
 
 
492 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  40 
 
 
70 aa  62.4  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  28.34 
 
 
400 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  27.89 
 
 
484 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  31.17 
 
 
396 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  25.7 
 
 
415 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  25.14 
 
 
483 aa  48.5  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  26.52 
 
 
393 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  25.88 
 
 
389 aa  45.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  28.49 
 
 
397 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  26.39 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  25.6 
 
 
402 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  25.6 
 
 
402 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>