More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4834 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  100 
 
 
411 aa  767    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  69.19 
 
 
421 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  57.35 
 
 
434 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  58.17 
 
 
423 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  57.74 
 
 
435 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  55.66 
 
 
474 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  55.42 
 
 
457 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  55.42 
 
 
474 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  55.42 
 
 
457 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  55.42 
 
 
474 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  55.19 
 
 
474 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  55.19 
 
 
474 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  55.77 
 
 
430 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  54.28 
 
 
445 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  54.15 
 
 
445 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  54.15 
 
 
428 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  54.39 
 
 
429 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  54.3 
 
 
416 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  55.17 
 
 
415 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  55.17 
 
 
415 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  54.68 
 
 
429 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  54.77 
 
 
428 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  54.07 
 
 
424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  54.7 
 
 
432 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  54.19 
 
 
424 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  53.83 
 
 
424 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  54.33 
 
 
398 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  54.33 
 
 
398 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  54.33 
 
 
398 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  47.77 
 
 
428 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  48.64 
 
 
428 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  47.77 
 
 
428 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  49.25 
 
 
435 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  48.02 
 
 
428 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  47.77 
 
 
428 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  49.14 
 
 
432 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  49.39 
 
 
432 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  49.39 
 
 
432 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  49.51 
 
 
432 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  50.12 
 
 
427 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  49.27 
 
 
434 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  49.14 
 
 
434 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  47.52 
 
 
409 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  47.9 
 
 
423 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  47.41 
 
 
423 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  47.28 
 
 
409 aa  359  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  44.28 
 
 
429 aa  342  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  43.78 
 
 
429 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  45.04 
 
 
420 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  44.55 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  44.55 
 
 
420 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  44.55 
 
 
420 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  45.25 
 
 
411 aa  338  9e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  46.9 
 
 
425 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  44.55 
 
 
420 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  46.9 
 
 
425 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 
430 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  44.28 
 
 
409 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  46.9 
 
 
434 aa  329  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 
423 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  46.9 
 
 
437 aa  318  9e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 
419 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  44.25 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  42.57 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  45.93 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  42.33 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  47.51 
 
 
436 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  41.08 
 
 
428 aa  277  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  41.04 
 
 
436 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  40.74 
 
 
433 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  38.82 
 
 
441 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  35.18 
 
 
415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  34.99 
 
 
415 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  34.18 
 
 
412 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  33.66 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  34.99 
 
 
415 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  34.99 
 
 
415 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  36.02 
 
 
410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  34.46 
 
 
415 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  34.46 
 
 
415 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  34.2 
 
 
415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  34.09 
 
 
408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  29.63 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  32.82 
 
 
410 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 
410 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  33.76 
 
 
402 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  32.32 
 
 
491 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  35.84 
 
 
418 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.41 
 
 
432 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.01 
 
 
433 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  29.41 
 
 
432 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  31.1 
 
 
425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.16 
 
 
433 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.16 
 
 
432 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.16 
 
 
433 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  31.79 
 
 
427 aa  156  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.01 
 
 
432 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>