42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4753 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  746    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  29.36 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  30 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  30.67 
 
 
316 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  29.43 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  28.03 
 
 
317 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3202  transposition protein, putative  29.96 
 
 
342 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0726  putative transposition protein  31.17 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  25.3 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  21.89 
 
 
351 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  26.95 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  25.49 
 
 
326 aa  59.7  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  28.43 
 
 
302 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  22.56 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  22.75 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  22.75 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  25.58 
 
 
301 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  25.58 
 
 
301 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  26.55 
 
 
312 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  25.88 
 
 
301 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  25 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  26.37 
 
 
301 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  24.39 
 
 
298 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  23.75 
 
 
308 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  21.66 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  28.76 
 
 
293 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  28.76 
 
 
293 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  28.76 
 
 
293 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  28.76 
 
 
293 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  26.97 
 
 
304 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  26.67 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  24.18 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  22.48 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  24.18 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  30.19 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  22.9 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  26.85 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  26.27 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  26.27 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  26.27 
 
 
305 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  23.3 
 
 
289 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  25.23 
 
 
294 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>