More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4731 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4789  transcriptional regulator, LysR family  82.08 
 
 		 308 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1309  LysR family transcriptional regulator  81.43 
 
 		 308 aa  454  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2051  transcriptional regulator, LysR family  53.56 
 
 		 300 aa  298  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1743  transcriptional regulator, LysR family  53.56 
 
 		 300 aa  298  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5891  LysR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2188  transcriptional regulator, LysR family  51.17 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2070  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518674  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2079  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843078  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2178  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6676  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6666  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0841  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 309 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.697299  normal  0.209982 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3715  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 304 aa  208  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  32.63 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1431  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2549  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 619 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.33908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0464  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4950  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2034  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0330  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1459  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  36.25 
 
 		 298 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0476  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 313 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.82 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0798  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0879  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2695  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5219  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.49 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5149  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 328 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3833  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2564  nitrogen assimilation transcriptional regulator  30.61 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000767636  normal  0.0977076 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4318  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.772143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3129  nitrogen assimilation transcriptional regulator  32.27 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2940  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0170064  decreased coverage  0.0000113665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0795  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1366  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.320453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0341  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5279  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.328918  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0942  nitrogen assimilation transcriptional regulator  33 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4600  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6361  nitrogen assimilation transcriptional regulator  32 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2501  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0165  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2999  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0222348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3416  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1833  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0629  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06880  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196299  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01898  DNA-binding transcriptional dual regulator of nitrogen assimilation  30.48 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01887  hypothetical protein  30.48 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0017445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1667  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0970  nitrogen assimilation transcriptional regulator  30.48 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243153  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6018  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550846  normal  0.605819 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6300  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2832  nitrogen assimilation transcriptional regulator  30.86 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000572709  normal  0.465707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2270  nitrogen assimilation transcriptional regulator  30.48 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000041726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1136  nitrogen assimilation transcriptional regulator  30.48 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190292  hitchhiker  0.000106963 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1657  nitrogen assimilation transcriptional regulator  30.48 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000208245  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  24.35 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2111  nitrogen assimilation transcriptional regulator  30.48 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.1125e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0663  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.650838 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0897  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3210  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1045  transcriptional regulator, LysR family  34.86 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0989  LysR, substrate-binding  30.83 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.745768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3816  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.898253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4227  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 345 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4206  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2041  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.881958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3701  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.037732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3202  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5877  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.673502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04720  Transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 299 aa  109  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0456  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0935  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.52 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1721  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0891841  normal  0.236435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>