More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4680 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
276 aa  543  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.77 
 
 
290 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.38 
 
 
282 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.74 
 
 
282 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.87 
 
 
279 aa  261  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 
291 aa  261  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
282 aa  258  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
291 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 
291 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 
291 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 
291 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.55 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
292 aa  249  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.1 
 
 
296 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  48.34 
 
 
286 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  48.13 
 
 
274 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  48.13 
 
 
274 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  48.13 
 
 
274 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 
280 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
276 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
289 aa  241  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 
280 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 
293 aa  241  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
276 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  48.33 
 
 
274 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
285 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
276 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.04 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.92 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 
295 aa  232  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.09 
 
 
280 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
281 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.25 
 
 
280 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
276 aa  228  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
280 aa  227  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  46.13 
 
 
284 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 
277 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  45.02 
 
 
284 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
282 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
279 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
285 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 
286 aa  221  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
274 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
286 aa  219  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
274 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
282 aa  215  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.62 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  44.32 
 
 
303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
279 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 
276 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
284 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 
274 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
283 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  40.6 
 
 
282 aa  208  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  44.85 
 
 
278 aa  208  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
285 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
290 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  44.16 
 
 
279 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  43.12 
 
 
287 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
281 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 
283 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
283 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
272 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  46.13 
 
 
284 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
275 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
272 aa  202  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
279 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.07 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  42.7 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
283 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
279 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  40 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 
276 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
273 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
284 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
290 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
290 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 
277 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.6 
 
 
282 aa  193  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>