More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4606 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  79.3 
 
 
463 aa  706    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.71 
 
 
437 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.69 
 
 
439 aa  634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  79.4 
 
 
434 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  79.17 
 
 
433 aa  701    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  72.29 
 
 
434 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.75 
 
 
438 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  79.17 
 
 
438 aa  694    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  72.52 
 
 
434 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  80.56 
 
 
434 aa  710    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.75 
 
 
438 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  69.68 
 
 
442 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  81.46 
 
 
440 aa  719    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  71.49 
 
 
439 aa  642    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  79.17 
 
 
438 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  83.52 
 
 
447 aa  728    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
456 aa  911    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  80.09 
 
 
434 aa  705    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  79.4 
 
 
438 aa  695    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  78.37 
 
 
452 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  69.68 
 
 
441 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.97 
 
 
436 aa  632  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.87 
 
 
435 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  71.59 
 
 
436 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.97 
 
 
434 aa  623  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.67 
 
 
436 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.89 
 
 
436 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  68.2 
 
 
435 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.52 
 
 
433 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.59 
 
 
433 aa  600  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.74 
 
 
438 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  67.43 
 
 
436 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.06 
 
 
434 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.4 
 
 
451 aa  552  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  60.45 
 
 
449 aa  541  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.36 
 
 
438 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.75 
 
 
434 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.75 
 
 
434 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.22 
 
 
434 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.52 
 
 
434 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.45 
 
 
438 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.06 
 
 
437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  61.29 
 
 
464 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  58.96 
 
 
441 aa  504  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.54 
 
 
478 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.97 
 
 
474 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.78 
 
 
453 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.18 
 
 
474 aa  478  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.35 
 
 
436 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.41 
 
 
467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.91 
 
 
438 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.14 
 
 
460 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.09 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  55.61 
 
 
473 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.05 
 
 
440 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.86 
 
 
460 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.55 
 
 
436 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  50.91 
 
 
446 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  50.11 
 
 
447 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  48.79 
 
 
482 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.57 
 
 
482 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  53.3 
 
 
435 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  53.3 
 
 
436 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.55 
 
 
457 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  50.33 
 
 
473 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  45.87 
 
 
435 aa  427  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.33 
 
 
473 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.09 
 
 
440 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.09 
 
 
440 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.11 
 
 
473 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  49.43 
 
 
440 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  48.62 
 
 
470 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  47.47 
 
 
437 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.89 
 
 
473 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  46.52 
 
 
466 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  47.76 
 
 
476 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.62 
 
 
470 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.62 
 
 
470 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  48.79 
 
 
470 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  47.47 
 
 
437 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  48.35 
 
 
470 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  48.18 
 
 
445 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.12 
 
 
457 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  49.43 
 
 
448 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  49.45 
 
 
454 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  47.74 
 
 
450 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  47.85 
 
 
440 aa  421  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  46.84 
 
 
427 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.76 
 
 
442 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  46.38 
 
 
440 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  48.16 
 
 
443 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.35 
 
 
470 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.32 
 
 
448 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.73 
 
 
450 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  49.21 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.83 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.97 
 
 
450 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.3 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 
447 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  47.29 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>