More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4542 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  77.54 
 
 
549 aa  781    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  76.29 
 
 
514 aa  738    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  77.15 
 
 
542 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1030    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  77.05 
 
 
529 aa  740    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  77.82 
 
 
540 aa  781    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  55.11 
 
 
523 aa  525  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  53.77 
 
 
562 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  53.31 
 
 
523 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  50.89 
 
 
506 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  51.79 
 
 
505 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  51.79 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  51.19 
 
 
505 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  49.31 
 
 
507 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  50.5 
 
 
507 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  50.1 
 
 
509 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  45.33 
 
 
504 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  45.14 
 
 
505 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  45.62 
 
 
513 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  50.2 
 
 
498 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  45.42 
 
 
513 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  43.29 
 
 
503 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  43.4 
 
 
509 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  45.17 
 
 
502 aa  356  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  39.6 
 
 
497 aa  335  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  40.17 
 
 
472 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  41.55 
 
 
362 aa  246  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  41.38 
 
 
360 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  42.53 
 
 
328 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
358 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  38.8 
 
 
365 aa  186  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 
363 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  38.44 
 
 
332 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  39.54 
 
 
323 aa  183  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  41.16 
 
 
342 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  39 
 
 
332 aa  173  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  42.47 
 
 
341 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  42.34 
 
 
341 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 
328 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  37.75 
 
 
327 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  34.87 
 
 
340 aa  144  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  35.16 
 
 
346 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
344 aa  131  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
348 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  34.27 
 
 
308 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 
333 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 
312 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  32.49 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
344 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  31.86 
 
 
387 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  32.7 
 
 
372 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  33.03 
 
 
341 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  32.15 
 
 
340 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  32.21 
 
 
338 aa  123  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  30.55 
 
 
331 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  29.87 
 
 
333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  31.11 
 
 
362 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  32.25 
 
 
330 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 
333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
323 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  34.98 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  30.87 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  30.16 
 
 
379 aa  117  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  32.12 
 
 
401 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  33.83 
 
 
336 aa  116  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  31.69 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  31.48 
 
 
339 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 
339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  31.17 
 
 
339 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  28.66 
 
 
345 aa  113  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  31.19 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  35.9 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  30.27 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  30.72 
 
 
427 aa  113  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  31.29 
 
 
384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 
339 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  27.1 
 
 
365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  30.92 
 
 
348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 
345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  27.1 
 
 
329 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  32.01 
 
 
344 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  28.76 
 
 
325 aa  111  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  32.01 
 
 
344 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  32.01 
 
 
344 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  32.01 
 
 
344 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  28.94 
 
 
340 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  29.58 
 
 
388 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  32.01 
 
 
344 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  28.57 
 
 
325 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  48.1 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  31.68 
 
 
401 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  33.12 
 
 
350 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  33.75 
 
 
357 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  31.37 
 
 
344 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3705  aminoglycoside phosphotransferase  33.93 
 
 
348 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  29.34 
 
 
361 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  30.66 
 
 
349 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  31.2 
 
 
363 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>