286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4527 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  100 
 
 
394 aa  781    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  69.95 
 
 
389 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  70.13 
 
 
379 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  68.38 
 
 
386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  69.52 
 
 
382 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  70.28 
 
 
382 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  49.62 
 
 
385 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  49.74 
 
 
383 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  49.12 
 
 
389 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  47.67 
 
 
368 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  49.37 
 
 
385 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  48.88 
 
 
382 aa  344  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  47.56 
 
 
383 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  49.49 
 
 
390 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  50.41 
 
 
379 aa  338  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  48.64 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  46.56 
 
 
407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  45.38 
 
 
398 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  39.77 
 
 
403 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  42.44 
 
 
399 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  42.9 
 
 
379 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  39.34 
 
 
384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  38.75 
 
 
382 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  37.72 
 
 
367 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  37.92 
 
 
376 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  33.16 
 
 
405 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  38.86 
 
 
382 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  40.63 
 
 
360 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  39.05 
 
 
393 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  39.34 
 
 
383 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  38.76 
 
 
387 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  38.1 
 
 
383 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  35.23 
 
 
344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  39.62 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  39.89 
 
 
393 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  36.95 
 
 
395 aa  223  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  35.33 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  38.55 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  33.09 
 
 
433 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  37.25 
 
 
394 aa  219  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  39.41 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  37.18 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  38.41 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  33.51 
 
 
355 aa  213  7e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  40.27 
 
 
359 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  38.16 
 
 
413 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  34.5 
 
 
387 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  33.69 
 
 
391 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  36.31 
 
 
406 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  34.83 
 
 
399 aa  206  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  36.72 
 
 
333 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  37.11 
 
 
357 aa  205  9e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  37.74 
 
 
359 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  40.91 
 
 
370 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  34.2 
 
 
395 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  37.87 
 
 
347 aa  203  4e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  35.47 
 
 
362 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  34.02 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  32.26 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  32.26 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  33.85 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  31.62 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  34.1 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  33.18 
 
 
452 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  37.63 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.2 
 
 
389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  35.51 
 
 
386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  32.64 
 
 
447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  37.63 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  31.18 
 
 
379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  31.18 
 
 
379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  31.18 
 
 
379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  31.62 
 
 
381 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  39.71 
 
 
309 aa  195  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36 
 
 
378 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  33.88 
 
 
378 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  35.39 
 
 
360 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  32.86 
 
 
382 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  36.1 
 
 
389 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  32.01 
 
 
477 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  34.41 
 
 
414 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  34.55 
 
 
405 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  35.71 
 
 
451 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  35.71 
 
 
451 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  34.04 
 
 
399 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  35.59 
 
 
393 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  30.81 
 
 
380 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  39.24 
 
 
397 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  39.24 
 
 
397 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  34.92 
 
 
393 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  33.68 
 
 
400 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  33.71 
 
 
464 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  36.7 
 
 
331 aa  190  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  27.47 
 
 
503 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  38.27 
 
 
306 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  33.7 
 
 
457 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  32.8 
 
 
394 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  35.31 
 
 
393 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  36.18 
 
 
471 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  34.01 
 
 
436 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>