More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4479 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  100 
 
 
143 aa  283  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  58.09 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  62.18 
 
 
131 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  57.72 
 
 
140 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  50.41 
 
 
132 aa  117  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  50.41 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  45.08 
 
 
142 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  46.46 
 
 
270 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 
123 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  45.45 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  39.1 
 
 
138 aa  93.2  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 
133 aa  92  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40.87 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.8 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  45.26 
 
 
228 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
129 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  42.61 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  43.9 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.61 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  43.9 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  42 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.02 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.39 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  41.88 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
129 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  40 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  39.37 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1527  Camphor resistance CrcB protein  37.41 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0201  camphor resistance CrcB protein  39.34 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  38.6 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  39.83 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  38.1 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  34.78 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  36.89 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.44 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  36.29 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.44 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  35.65 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  42.19 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  43.33 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  40.34 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  43.82 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  33.07 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  32.77 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  35.54 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  37.3 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  37.3 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  34.68 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  34.43 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>