41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4266 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4266  SOUL heme-binding protein  100 
 
 
201 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.409144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1762  SOUL heme-binding protein  56.06 
 
 
201 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3441  SOUL heme-binding protein  47.14 
 
 
208 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4115  SOUL heme-binding protein  45.37 
 
 
209 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.721347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1935  SOUL heme-binding protein  44.66 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3219  SOUL heme-binding protein  44.66 
 
 
214 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918891  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2357  SOUL heme-binding protein  47.69 
 
 
196 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3007  SOUL heme-binding protein  44.85 
 
 
197 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  38.73 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  38.73 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  39.69 
 
 
222 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2884  SOUL heme-binding protein  39.68 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0215934  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3628  SOUL heme-binding protein  37.07 
 
 
199 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146783  normal  0.903477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  35.75 
 
 
205 aa  111  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  32.02 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1279  SOUL heme-binding protein  39.68 
 
 
211 aa  108  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  34.52 
 
 
213 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  35.79 
 
 
206 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  35.75 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  38.46 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1349  putative SOUL heme-binding protein  34.33 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1702  SOUL heme-binding protein  29.47 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.047205  normal  0.584575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0157  SOUL heme-binding protein  37.29 
 
 
179 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  33.7 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2304  SOUL heme-binding protein  32.37 
 
 
166 aa  92  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00025626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1033  SOUL heme-binding protein  43.75 
 
 
192 aa  92  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  31.61 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  39.25 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2566  SOUL heme-binding protein  34.03 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0552192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0086  SOUL heme-binding protein  36.31 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502327  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  34.83 
 
 
204 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1687  hypothetical protein  36.48 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00350109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  37.63 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2524  SOUL heme-binding protein  37.29 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35858  predicted protein  35.75 
 
 
231 aa  82  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000296008  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46002  predicted protein  35.75 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0390723  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0864  hypothetical protein  36.16 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30678  predicted protein  37.97 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800735  normal  0.996732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0854  SOUL heme-binding protein  35.06 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  30.65 
 
 
363 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0544  SOUL heme-binding protein  32.53 
 
 
115 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.301676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>