More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4227 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
418 aa  813    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  73.05 
 
 
420 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  59.17 
 
 
417 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  59.31 
 
 
416 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  52.51 
 
 
413 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  54.16 
 
 
424 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.81 
 
 
413 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  59.2 
 
 
411 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  55.56 
 
 
413 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.56 
 
 
413 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  54.8 
 
 
413 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  52.78 
 
 
411 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  52.53 
 
 
411 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.25 
 
 
440 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  51.22 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.06 
 
 
430 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  49.15 
 
 
412 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.15 
 
 
412 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.15 
 
 
412 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.26 
 
 
412 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.77 
 
 
451 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.77 
 
 
412 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.77 
 
 
412 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.77 
 
 
412 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.77 
 
 
412 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.77 
 
 
412 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  54.08 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  48.49 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.65 
 
 
399 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  52.28 
 
 
412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.12 
 
 
403 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  49.88 
 
 
414 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  49.24 
 
 
414 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  50.51 
 
 
405 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.88 
 
 
412 aa  345  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.99 
 
 
410 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  45.82 
 
 
425 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.62 
 
 
407 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.85 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48 
 
 
415 aa  340  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.51 
 
 
429 aa  339  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.77 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.13 
 
 
401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.17 
 
 
402 aa  336  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 
413 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  48.3 
 
 
401 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  49.39 
 
 
411 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  49.39 
 
 
411 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  48.87 
 
 
406 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.61 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.87 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.04 
 
 
426 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.09 
 
 
393 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.3 
 
 
397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  47.55 
 
 
405 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.4 
 
 
415 aa  315  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.13 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.43 
 
 
419 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.59 
 
 
433 aa  312  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.77 
 
 
393 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  46.19 
 
 
419 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.49 
 
 
425 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  41.25 
 
 
422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.08 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.29 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45 
 
 
419 aa  298  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.26 
 
 
418 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.55 
 
 
413 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.56 
 
 
404 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.83 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.3 
 
 
395 aa  269  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.28 
 
 
404 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.56 
 
 
404 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.56 
 
 
400 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.56 
 
 
404 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.5 
 
 
392 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.99 
 
 
425 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  41.37 
 
 
395 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.04 
 
 
412 aa  259  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  40.98 
 
 
326 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.08 
 
 
413 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.83 
 
 
410 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  45.15 
 
 
403 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.69 
 
 
395 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  44.3 
 
 
398 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.3 
 
 
398 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.8 
 
 
398 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.05 
 
 
415 aa  227  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.64 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  40.64 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.64 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.96 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3110  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  37.4 
 
 
375 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.46 
 
 
407 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.86 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  35.83 
 
 
419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.83 
 
 
412 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3455  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.19 
 
 
225 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.37 
 
 
407 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.513495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>