67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4200 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  73.38 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  73.38 
 
 		 176 aa  238  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  72.08 
 
 		 176 aa  235  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  67.25 
 
 		 177 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  56.69 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  56.96 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  46.51 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  47.83 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  44.97 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  48.73 
 
 		 179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  46.84 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  41.67 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  43.12 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  44.83 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  45.22 
 
 		 176 aa  138  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  44.59 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  44.81 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  43.95 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  44.2 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  45.28 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  46.89 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  43.31 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  40.91 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  39.88 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  36.09 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  35.5 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  37.42 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  38.41 
 
 		 185 aa  94.4  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  33.96 
 
 		 178 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  34.1 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  40.54 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  36.64 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  39.45 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  32.62 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  34.78 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  43.27 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  31.91 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  30.63 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  32.62 
 
 		 136 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  30.94 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  28.97 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  27.78 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  32.68 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  35.14 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  28.28 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  29.45 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  28.28 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  28.28 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  28.28 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  28.28 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  27.08 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  32.03 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  31.88 
 
 		 138 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  27.97 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  27.97 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  35.24 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  35.24 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  29.17 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  48.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  29.63 
 
 		 142 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  29.13 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  27.07 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  30.28 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2238  hypothetical protein  38.3 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>