More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4159 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  100 
 
 
151 aa  304  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  100 
 
 
151 aa  304  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  100 
 
 
151 aa  304  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  50.64 
 
 
158 aa  137  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  42.14 
 
 
294 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  44.03 
 
 
304 aa  120  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  43.75 
 
 
303 aa  120  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  43.75 
 
 
303 aa  120  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  43.75 
 
 
303 aa  120  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  39.19 
 
 
260 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  43.24 
 
 
259 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  43.95 
 
 
188 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  43.92 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.13 
 
 
281 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  43.24 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  43.24 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.47 
 
 
281 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.16 
 
 
281 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  38.36 
 
 
177 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  43.85 
 
 
260 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  43.85 
 
 
260 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  38.1 
 
 
260 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  38.1 
 
 
260 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  38.1 
 
 
260 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  38.1 
 
 
260 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.13 
 
 
281 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  42.31 
 
 
273 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  40 
 
 
255 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  40.25 
 
 
184 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  40.25 
 
 
184 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  37.84 
 
 
253 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  37.84 
 
 
253 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  37.84 
 
 
253 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  37.84 
 
 
253 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  36.49 
 
 
164 aa  94  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  33.33 
 
 
252 aa  93.6  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  33.78 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  33.78 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  33.78 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  33.78 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.81 
 
 
251 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  33.78 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  34.01 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  39.33 
 
 
255 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  37.41 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  37.41 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  37.16 
 
 
253 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  35.81 
 
 
164 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  35.81 
 
 
164 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  35.81 
 
 
164 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  35.81 
 
 
164 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  31.08 
 
 
249 aa  91.3  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  34.48 
 
 
255 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  31.08 
 
 
249 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  35.81 
 
 
266 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  35.1 
 
 
249 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  34.23 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  34.93 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0325  hypothetical protein  39.33 
 
 
255 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  36.18 
 
 
252 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0244  hypothetical protein  39.33 
 
 
255 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0187  hypothetical protein  39.33 
 
 
255 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  36.18 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  36.18 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  36.18 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  36.18 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  36.18 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  36.18 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  36.18 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  36.18 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  33.78 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  32.43 
 
 
176 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  33.78 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  32.43 
 
 
176 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  40.91 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  36.11 
 
 
254 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  46.15 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  36.11 
 
 
254 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  36.11 
 
 
254 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  36.11 
 
 
254 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  36.11 
 
 
254 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  35.66 
 
 
254 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  35.66 
 
 
254 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  35.66 
 
 
254 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  35.66 
 
 
254 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  35.66 
 
 
254 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  35.66 
 
 
254 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  37.59 
 
 
146 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  37.93 
 
 
252 aa  87  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  37.93 
 
 
252 aa  87  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  37.93 
 
 
167 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  34.87 
 
 
254 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  36.24 
 
 
251 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  34.67 
 
 
336 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  33.11 
 
 
249 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  37.74 
 
 
287 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  33.11 
 
 
249 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  36.24 
 
 
251 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  34.67 
 
 
190 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  36.69 
 
 
129 aa  85.5  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>