More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4081 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 441 aa  841    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  70.52 
 
 		 444 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  70.55 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  70.62 
 
 		 444 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  64.25 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  66.67 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  50.34 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  51.94 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  48.42 
 
 		 448 aa  348  8e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  47.79 
 
 		 456 aa  346  6e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  46.95 
 
 		 442 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  47.17 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  47.17 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  51.35 
 
 		 435 aa  342  9e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  50.9 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  48.1 
 
 		 438 aa  336  5e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  48.19 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  50.11 
 
 		 438 aa  329  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  45.83 
 
 		 457 aa  322  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  49.34 
 
 		 455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  46.45 
 
 		 462 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  43.31 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  46.9 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  45.49 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0137  tRNA modification GTPase TrmE  48.89 
 
 		 437 aa  316  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  46.24 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  46.55 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  44.37 
 
 		 429 aa  312  7.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  37.83 
 
 		 439 aa  307  3e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  45.69 
 
 		 460 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  45.74 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  45.74 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  45.84 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  41.63 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  47.61 
 
 		 447 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  42.82 
 
 		 437 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  40.39 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  40.69 
 
 		 454 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 454 aa  285  8e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  42.73 
 
 		 437 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  36.83 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  40.82 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  40.26 
 
 		 454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  40.26 
 
 		 454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  40.26 
 
 		 454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  40.6 
 
 		 454 aa  282  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 467 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 454 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 467 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 454 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 467 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0003  tRNA modification GTPase TrmE  44.47 
 
 		 419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  43.56 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  40.44 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  41.33 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  38.21 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  41.45 
 
 		 462 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2853  tRNA modification GTPase TrmE  47.09 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0789426 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  40.12 
 
 		 489 aa  263  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  36.33 
 
 		 478 aa  263  4.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 455 aa  263  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  36.28 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  36.28 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  39.08 
 
 		 455 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 457 aa  259  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 453 aa  259  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  37.66 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 452 aa  257  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2881  tRNA modification GTPase TrmE  42.76 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  34.2 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  36.68 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  36.4 
 
 		 453 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  34.2 
 
 		 458 aa  256  7e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  35.88 
 
 		 453 aa  256  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  38.26 
 
 		 458 aa  255  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  40.77 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  38.81 
 
 		 471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4256  tRNA modification GTPase TrmE  36.74 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 475 aa  254  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  38.58 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  38.24 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 453 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>