More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4073 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  42.65 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  42.72 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  50.5 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  50.5 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  50.5 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  50.5 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  50.5 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  50.5 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  50.5 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  49.5 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  41.56 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  38.82 
 
 		 337 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  39.11 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  43.8 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  48.51 
 
 		 214 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  48.54 
 
 		 441 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  36.87 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  27.74 
 
 		 497 aa  93.2  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  31.17 
 
 		 481 aa  93.2  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  44.93 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  38.83 
 
 		 510 aa  92.4  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  27.91 
 
 		 479 aa  92.4  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  47.52 
 
 		 214 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 215 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  33.33 
 
 		 484 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 623 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 232 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  41.3 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  46.53 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  43.69 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 440 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 221 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40 
 
 		 226 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  51.58 
 
 		 386 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 537 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 1026 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  51.58 
 
 		 386 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.08 
 
 		 890 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 230 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 487 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  44.12 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  43.14 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43.14 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 234 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 630 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  39.71 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 		 586 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 		 221 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  36.3 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  38.76 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  32.69 
 
 		 656 aa  87  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 		 221 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 487 aa  87  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  38.39 
 
 		 640 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  48 
 
 		 215 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  38.76 
 
 		 228 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  38.76 
 
 		 219 aa  86.7  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  38.76 
 
 		 219 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  38.76 
 
 		 219 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 209 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 		 510 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 175 aa  86.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  41.32 
 
 		 451 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  41.58 
 
 		 221 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 		 485 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  48.51 
 
 		 729 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  43 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.74 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  40 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.98 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  39.55 
 
 		 216 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  37.98 
 
 		 222 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  37.19 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  50.53 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  39.55 
 
 		 216 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 209 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  45.05 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 		 217 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 217 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  45.1 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  44.12 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  37.59 
 
 		 631 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  39.45 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  42.57 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  32.8 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>