More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3978 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3978  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 331 aa  634    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  decreased coverage  0.00138187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  69.21 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  69.72 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  68.9 
 
 		 325 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  68.07 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  67.99 
 
 		 325 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  59.27 
 
 		 331 aa  349  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  56.66 
 
 		 323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  54.77 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  54.74 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  54.46 
 
 		 330 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  55.66 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  51.38 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  54.77 
 
 		 323 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  50.77 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4282  thiamine-monophosphate kinase  53.09 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0547325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  46.67 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  47.29 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  44.44 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  45.03 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  36.89 
 
 		 319 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  45.43 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  38.04 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  43.73 
 
 		 361 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  40.66 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  37.2 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  43.43 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  38.25 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  43.98 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  40.84 
 
 		 326 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  38.96 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  36.89 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  37.88 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  40.07 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  41.14 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  36.56 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.07 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  39.47 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  37.99 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  35.59 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  32.31 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  39.8 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  38.89 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  40.96 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  39.47 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  30.49 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  39.47 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  41.37 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  36.81 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  45.2 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  32.93 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  35.43 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  42.53 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  39.94 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  40.8 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  39.76 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  40.9 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  41.05 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  40.36 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1679  thiamine-monophosphate kinase  42.12 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.34027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  40.6 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  38.37 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  34.04 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  39.57 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.82 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  39.04 
 
 		 329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.34 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  39.87 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  39.37 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  36.67 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  34.12 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  36.36 
 
 		 329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  37.57 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  40.74 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  40.36 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.37 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  40.06 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  36.36 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  41.25 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  41.25 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  41.25 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  39.12 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  41.25 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  41.25 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  41.25 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  41.25 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  39.76 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  39.77 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  40.95 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  35.15 
 
 		 326 aa  159  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  32.94 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  41.33 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  37 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  37.41 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>