More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3880 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  100 
 
 
413 aa  816    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  74.76 
 
 
468 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  66.83 
 
 
413 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  66.83 
 
 
417 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  61.84 
 
 
412 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  62.32 
 
 
412 aa  500  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  62.56 
 
 
411 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  61.87 
 
 
417 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  51.43 
 
 
418 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  47.83 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  42.93 
 
 
407 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  42.69 
 
 
407 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  42.69 
 
 
407 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  42.89 
 
 
405 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0401  cytochrome P450  41.75 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  40.1 
 
 
402 aa  272  8.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  40.14 
 
 
419 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  38 
 
 
401 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.89 
 
 
398 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.88 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  39.81 
 
 
423 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.54 
 
 
412 aa  247  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  41.98 
 
 
416 aa  243  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.38 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.5 
 
 
399 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.81 
 
 
410 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  36.13 
 
 
417 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  36.45 
 
 
409 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.66 
 
 
388 aa  233  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  37.75 
 
 
427 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.75 
 
 
407 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.13 
 
 
426 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.15 
 
 
408 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  38.4 
 
 
411 aa  225  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  35.8 
 
 
399 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  34.25 
 
 
402 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  36.8 
 
 
405 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  35.4 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.03 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.55 
 
 
406 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  36.72 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.1 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  35.66 
 
 
407 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  32.6 
 
 
422 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  41.37 
 
 
411 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  37.19 
 
 
410 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  33.75 
 
 
402 aa  220  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.79 
 
 
417 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  33.9 
 
 
407 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  42.01 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  38.78 
 
 
423 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.91 
 
 
411 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.22 
 
 
400 aa  216  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  36.58 
 
 
411 aa  215  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  36.05 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  36.05 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  35.66 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.53 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.79 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  35.22 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  35.79 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  34.41 
 
 
411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  35.79 
 
 
411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  39.07 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  36.91 
 
 
409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  34.74 
 
 
411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  38.32 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  38.26 
 
 
423 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  36 
 
 
408 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.85 
 
 
420 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  41.69 
 
 
402 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.15 
 
 
412 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  33.17 
 
 
400 aa  210  4e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.97 
 
 
412 aa  209  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  36.21 
 
 
404 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  38.5 
 
 
430 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  43.28 
 
 
419 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.76 
 
 
400 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  35.75 
 
 
417 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  32.92 
 
 
399 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  42.04 
 
 
395 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  32.5 
 
 
398 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.76 
 
 
417 aa  206  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.23 
 
 
414 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.65 
 
 
380 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.43 
 
 
419 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.88 
 
 
401 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  41.64 
 
 
423 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  35.85 
 
 
418 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  38.1 
 
 
418 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  37.92 
 
 
421 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.5 
 
 
410 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36 
 
 
394 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  38.77 
 
 
409 aa  200  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  38.85 
 
 
408 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  33 
 
 
396 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  33.33 
 
 
405 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  34.17 
 
 
421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.74 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  36.7 
 
 
399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>