139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3790 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  57.56 
 
 		 261 aa  294  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  58.15 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  57.2 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  56.88 
 
 		 267 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  59.19 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  49.25 
 
 		 265 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  46.86 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  46.24 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  46.89 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  48.52 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  44.61 
 
 		 266 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  45.42 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  47.93 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  50.23 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  42.45 
 
 		 250 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  45.83 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  36.47 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  40.17 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  43.65 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  37.83 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  43.27 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  42.64 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  38.55 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  35.53 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  41.62 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  34.98 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  37.06 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  39.8 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  40.31 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  35.39 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4199  Flp pilus assembly protein CpaB  42.65 
 
 		 193 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.335667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  37.93 
 
 		 322 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  34.62 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  36.79 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  35.39 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  34.98 
 
 		 342 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  35.79 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  32.84 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0666  Flp pilus assembly protein CpaB  32.88 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  32.49 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  35.53 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  31.44 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  32.99 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  35.86 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  35.5 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  39.24 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  37.31 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  35.05 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  35.75 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  36.79 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  36.17 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  36.79 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  36.79 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  30.61 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  33.18 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  34.01 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  32.32 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  35.23 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  35.23 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  32.56 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  35.42 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  31.22 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  38.22 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  34 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  31.4 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  33.02 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  30.55 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  32.34 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.36 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  27.23 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  32.77 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  31.76 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  31.76 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  31.76 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  31.76 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.22 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.76 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  31.76 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  34.05 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  34.05 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  30.37 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  30.57 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  33.77 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  31.66 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  29.29 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  28.91 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  31.44 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  31.41 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  32.46 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  32.09 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  38.4 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  29.37 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  28.5 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  29.61 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  38.4 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  30.12 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  35.68 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  38.4 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>