200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3706 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3706  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 102 aa  200  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.325898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1720  RNA-binding S4 domain protein  77.53 
 
 		 93 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4903  RNA-binding S4 domain protein  70.79 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4856  RNA-binding S4 domain protein  73.81 
 
 		 91 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0730838  normal  0.183947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4393  RNA-binding S4 domain-containing protein  73.81 
 
 		 91 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.853125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4803  RNA-binding S4 domain-containing protein  78.65 
 
 		 93 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0850807  decreased coverage  0.0000637783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3135  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.52 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1369  RNA-binding S4 domain protein  59.76 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.454269 
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  56.63 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  47.37 
 
 		 124 aa  93.6  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  56.63 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.22 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3377  RNA-binding S4  52.94 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000950352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0549  RNA-binding S4  50.6 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213997  normal  0.0613086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3310  RNA-binding S4  46.24 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290008  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1087  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.81 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0254  RNA-binding S4 domain protein  55.56 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2423  putative heat shock protein 15 (HSP15)  50.6 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00936684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  45.78 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1697  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.5 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3089  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.16 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0505  RNA-binding S4  44.83 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0154787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2640  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.25 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  44.58 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0491  RNA-binding S4 domain protein  48.19 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0410  RNA-binding S4  45.98 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.553472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  41.94 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4117  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.51 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  44.94 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  46.34 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  41.46 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  47.06 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  43.75 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0075  RNA-binding S4  46.25 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0546  RNA-binding S4  45.24 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.879286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  43.9 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  48.05 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  40 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  47.5 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  48.05 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.71 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  47.06 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  47.06 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  44.05 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  47.06 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  47.06 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  47.06 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  47.06 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  47.06 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0280  RNA-binding S4  51.19 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.16081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1827  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000868037  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  48.05 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  42.11 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  42.11 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.71 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  46.84 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  47.5 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2740  RNA-binding S4  38.71 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.944293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.71 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.24 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  44.58 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.58 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.68 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.58 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  43.37 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  40.24 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.37 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  43.18 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1368  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  45.45 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.3 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.98 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  43.04 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  44.3 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  36.67 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  38.3 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  37.97 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  40.24 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.17 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2572  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.68 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000329633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0776  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.58 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00252001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1817  heat shock protein 15  45.57 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0313  RNA-binding S4 domain protein  40.51 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4705  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  40.51 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.39239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  40.51 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3678  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  40.51 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479283 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  40.51 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0313  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  40.51 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  40.51 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7545  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  42.35 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  44.71 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.23 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68630  putative heat shock protein  38.04 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  44.3 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  43.75 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1173  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.04 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116219 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>