41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3591 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  70.9 
 
 		 253 aa  337  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  66.8 
 
 		 253 aa  324  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2913  LmbE family protein  66.93 
 
 		 253 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821813  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  66 
 
 		 254 aa  289  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  51.64 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3426  LmbE family protein  51.34 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00141665  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  36.64 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  34.48 
 
 		 269 aa  85.9  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  30.3 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3367  hypothetical protein  38.01 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232623 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  30.86 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  30.84 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  31.4 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  30.22 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  30.09 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  30.88 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  30.88 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  22.65 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  33.55 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2070  hypothetical protein  28.83 
 
 		 338 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  24.77 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  26.05 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  36.36 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  35.71 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  30.29 
 
 		 277 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  30.73 
 
 		 276 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  28.85 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.75 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  33.01 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  30.13 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  27.73 
 
 		 265 aa  45.4  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  30.14 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  36 
 
 		 447 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.04 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  25.69 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.07 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  25.55 
 
 		 302 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  30.82 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2086  LmbE-like protein  26.39 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  28.96 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>