More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3536 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  39.85 
 
 		 924 aa  672    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  57.37 
 
 		 941 aa  698    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  55.2 
 
 		 915 aa  639    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  57.08 
 
 		 932 aa  713    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  56.62 
 
 		 937 aa  705    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 937 aa  658    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 928 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  55.19 
 
 		 979 aa  1090    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  39.62 
 
 		 942 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.1 
 
 		 934 aa  682    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  40.75 
 
 		 933 aa  687    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  79.48 
 
 		 1016 aa  1634    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  55 
 
 		 976 aa  1089    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  78.77 
 
 		 1024 aa  1668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  40.88 
 
 		 928 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 941 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  54.49 
 
 		 1004 aa  1066    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  53.55 
 
 		 1010 aa  1050    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 928 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  37.72 
 
 		 930 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  55.27 
 
 		 937 aa  707    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  58.91 
 
 		 1043 aa  1186    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  55.15 
 
 		 978 aa  1096    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  85.4 
 
 		 1047 aa  1790    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  56.92 
 
 		 940 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 939 aa  720    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  55.62 
 
 		 999 aa  1069    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  53.28 
 
 		 992 aa  1050    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 943 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  53.66 
 
 		 1032 aa  1049    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  47.35 
 
 		 945 aa  829    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  56.51 
 
 		 929 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 957 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  53.59 
 
 		 1021 aa  1055    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  61.19 
 
 		 1000 aa  1241    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 944 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  53.24 
 
 		 979 aa  1050    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  39.66 
 
 		 937 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  54.58 
 
 		 1033 aa  1066    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 928 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  53.24 
 
 		 1014 aa  1016    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  58.56 
 
 		 943 aa  698    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  85.4 
 
 		 1047 aa  1790    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  58.57 
 
 		 935 aa  717    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  47.89 
 
 		 937 aa  849    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  39.39 
 
 		 930 aa  667    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  56.05 
 
 		 978 aa  1101    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  50.91 
 
 		 968 aa  984    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  59.34 
 
 		 973 aa  735    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  85.78 
 
 		 1047 aa  1801    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1542  DNA polymerase I  38.84 
 
 		 940 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  59.72 
 
 		 928 aa  777    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  59.73 
 
 		 1013 aa  1170    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  55.42 
 
 		 937 aa  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  54.18 
 
 		 1025 aa  1048    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  39.39 
 
 		 941 aa  651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  54.19 
 
 		 1020 aa  1033    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  54.33 
 
 		 1016 aa  1054    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  100 
 
 		 1060 aa  2150    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  39.28 
 
 		 947 aa  634  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0390  DNA polymerase I  39.25 
 
 		 923 aa  634  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  38.15 
 
 		 963 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0448  DNA polymerase I  39.25 
 
 		 923 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  55.45 
 
 		 924 aa  628  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 1024 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  37.85 
 
 		 936 aa  619  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 949 aa  612  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  37.4 
 
 		 939 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  35.88 
 
 		 956 aa  604  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  35.84 
 
 		 939 aa  602  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  46.87 
 
 		 951 aa  602  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  36.79 
 
 		 936 aa  595  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 932 aa  589  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 936 aa  591  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  35.8 
 
 		 946 aa  592  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  50.72 
 
 		 903 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 946 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  49.84 
 
 		 908 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  49.2 
 
 		 913 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  36.99 
 
 		 965 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  48.73 
 
 		 917 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  35.89 
 
 		 924 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  47 
 
 		 915 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  47.3 
 
 		 915 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  47.15 
 
 		 915 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  47.46 
 
 		 915 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  34.87 
 
 		 943 aa  560  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  48.25 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  48.25 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  48.25 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  48.25 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  49.28 
 
 		 903 aa  559  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  48.25 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  37.52 
 
 		 972 aa  557  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  47.36 
 
 		 891 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  48.25 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  47.92 
 
 		 912 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  48.25 
 
 		 928 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  48.25 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  48.25 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>