More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3532 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  78.34 
 
 		 337 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  78.34 
 
 		 337 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  78.93 
 
 		 337 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  77.08 
 
 		 331 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  74.7 
 
 		 331 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  59.82 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  58.98 
 
 		 333 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  60.53 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  59.23 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  58.98 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  58.51 
 
 		 333 aa  362  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  55.52 
 
 		 333 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  54.03 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  56.62 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  54.63 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  51.81 
 
 		 330 aa  342  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  54.43 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  52.08 
 
 		 330 aa  339  5e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  52.08 
 
 		 330 aa  339  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  55.22 
 
 		 333 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  54.08 
 
 		 407 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  51.05 
 
 		 330 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  51.64 
 
 		 330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  50.59 
 
 		 331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  49.25 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  50.75 
 
 		 330 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  51.35 
 
 		 332 aa  315  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  51.79 
 
 		 329 aa  311  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  50 
 
 		 342 aa  308  9e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  50.45 
 
 		 338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  43.56 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  43.98 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  44.82 
 
 		 335 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  52.28 
 
 		 338 aa  292  7e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  49.69 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  49.25 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  48.06 
 
 		 330 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  47.62 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  47.76 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  52.02 
 
 		 330 aa  271  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  49.7 
 
 		 330 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  37.35 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  38.3 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  38.91 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  38.6 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  43.7 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  41.89 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  43.62 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  43.64 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  43.57 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  35.09 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.03 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  34.36 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  38.04 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  34.7 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  32.52 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  32.82 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  34.94 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  36.31 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  32.7 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.79 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.31 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  29.88 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.91 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  34.07 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.52 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  36.5 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  33.71 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  33.57 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  33.54 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  31.95 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  29.54 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  31.77 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.5 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  32.59 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  29.38 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  31.34 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  34.71 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  32.06 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  29.27 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  29.79 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  31.34 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  34.96 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  29.83 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  31.55 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  29.72 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29.09 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  29.88 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  27.17 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  27.54 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  34.55 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>