31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3496 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3496  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  323  7e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  66.21 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  70.54 
 
 		 160 aa  185  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  71.31 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  66.12 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  64.46 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  46.5 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  49.33 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  46.75 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  46.4 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  42.58 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  48.21 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0606  hypothetical protein  37.42 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.090863  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5129  hypothetical protein  41.59 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  38.58 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  39.81 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  35.38 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  39.66 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  33.62 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  34.92 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  31.43 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  33.87 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 499 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 499 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  27.03 
 
 		 507 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  37.31 
 
 		 463 aa  41.6  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  41.18 
 
 		 574 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2580  hypothetical protein  26.85 
 
 		 217 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.948349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  29.2 
 
 		 483 aa  40.8  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>