More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3415 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  83.79 
 
 
543 aa  935    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  83.43 
 
 
543 aa  931    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  83.27 
 
 
556 aa  931    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1126    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  75.55 
 
 
544 aa  849    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  75.74 
 
 
544 aa  844    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  46.6 
 
 
546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  43.35 
 
 
586 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  41.34 
 
 
559 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.72 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  38.85 
 
 
581 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  39.72 
 
 
581 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  40.14 
 
 
560 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  40.04 
 
 
568 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.25 
 
 
559 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.65 
 
 
592 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.38 
 
 
584 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  39.03 
 
 
582 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  39.33 
 
 
582 aa  359  6e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  38.2 
 
 
582 aa  356  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.35 
 
 
559 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  36.81 
 
 
591 aa  353  4e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.26 
 
 
558 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.06 
 
 
501 aa  337  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.9 
 
 
501 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.73 
 
 
561 aa  312  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  32.55 
 
 
561 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.55 
 
 
561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  32.85 
 
 
560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  32.85 
 
 
560 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  34.63 
 
 
599 aa  293  6e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  34.71 
 
 
557 aa  290  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.41 
 
 
563 aa  289  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  30.71 
 
 
558 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  32.97 
 
 
565 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  30.64 
 
 
558 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  34.62 
 
 
562 aa  279  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  33.46 
 
 
552 aa  274  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  32.93 
 
 
557 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.68 
 
 
558 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  34.01 
 
 
551 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.18 
 
 
559 aa  270  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5398  hypothetical protein  41.23 
 
 
538 aa  266  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61189  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  31.39 
 
 
564 aa  265  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  35.43 
 
 
557 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.02 
 
 
552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  31.73 
 
 
558 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  30.42 
 
 
558 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  30.32 
 
 
556 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.2 
 
 
559 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.44 
 
 
559 aa  249  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.18 
 
 
522 aa  246  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.77 
 
 
509 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.53 
 
 
550 aa  242  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.49 
 
 
504 aa  242  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  32.9 
 
 
557 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.64 
 
 
557 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  32.83 
 
 
557 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.87 
 
 
563 aa  240  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.66 
 
 
552 aa  240  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  33.13 
 
 
544 aa  239  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.26 
 
 
552 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  35.98 
 
 
549 aa  239  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.56 
 
 
551 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  36.43 
 
 
542 aa  238  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.07 
 
 
506 aa  238  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.39 
 
 
525 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.39 
 
 
525 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.39 
 
 
525 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.39 
 
 
525 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  35.48 
 
 
549 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.66 
 
 
573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.1 
 
 
557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  28.78 
 
 
558 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.39 
 
 
525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.83 
 
 
534 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.07 
 
 
554 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.94 
 
 
546 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.35 
 
 
555 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.04 
 
 
547 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.43 
 
 
525 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.43 
 
 
525 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.99 
 
 
540 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.05 
 
 
525 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.7 
 
 
514 aa  231  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.97 
 
 
525 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  30.33 
 
 
549 aa  231  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.82 
 
 
546 aa  230  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.22 
 
 
525 aa  230  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.1 
 
 
559 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.44 
 
 
546 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.44 
 
 
546 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.44 
 
 
546 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.47 
 
 
525 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.44 
 
 
546 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  34.44 
 
 
546 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.44 
 
 
546 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.44 
 
 
546 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.44 
 
 
546 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.8 
 
 
525 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>