More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3409 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3409  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 362 aa  709    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000197592 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0764  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.82 
 
 		 348 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  43.6 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1692  LacI family transcription regulator  40.91 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0805  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.79 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1397  LacI family transcription regulator  38.18 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620296 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5195  transcriptional regulator LacI family  40 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6244  transcriptional regulator, LacI family  39.34 
 
 		 358 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6093  LacI family transcription regulator  38.34 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4590  LacI family transcription regulator  37.88 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1347  LacI family transcription regulator  36.23 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1014  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.23 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6609  LacI family transcription regulator  37.22 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.423679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6427  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1382  LacI family transcription regulator  39.53 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.641116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1342  LacI family transcription regulator  38.63 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2029  HTH-type transcriptional repressor  38.28 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.169196 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5762  LacI family transcription regulator  37.84 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6127  LacI family transcription regulator  37.84 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.401704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1046  regulatory protein, LacI  34.33 
 
 		 357 aa  185  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7624  LacI family transcription regulator  38.39 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4504  regulatory protein, LacI  36.59 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3387  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 		 340 aa  179  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  36.61 
 
 		 332 aa  179  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4082  LacI family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3976  LacI family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.637637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4021  LacI family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0916  transcriptional regulator, LacI family  36.14 
 
 		 340 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3914  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  34.83 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  32.36 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0436  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0321494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  35.93 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.83 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4642  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.23 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.44 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.72 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  33.12 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  37.35 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.32 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  32.32 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  32.32 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1266  transcriptional regulator, LacI family  36.25 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  38.11 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.63 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.23 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.23 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3418  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.612979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.71 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.31 
 
 		 332 aa  156  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.5 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.25 
 
 		 335 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  34.1 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  30.64 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.94 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  30.64 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2477  transcriptional regulator, LacI family  32.48 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  34.57 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0519  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1562  LacI family transcription regulator  32.12 
 
 		 338 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0696  transcriptional regulator, LacI family  37.86 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.477401 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.18 
 
 		 336 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1131  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5388  LacI family transcription regulator  33.66 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  30.64 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  30.64 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.06 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  30.54 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  35.47 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  30.3 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  30.3 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3453  LacI family transcription regulator  34.44 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.286826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  30.3 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>