296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3407 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3407  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 269 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  decreased coverage  0.0000181243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  46.25 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  46.85 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  47.64 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  46.46 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  37.94 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  40.55 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  39.69 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  40.16 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  38.91 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  39.3 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  39.92 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  38.13 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  38.52 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  38.13 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  38.58 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  37.85 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  38.34 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  37.7 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  40.23 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  38.65 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  43.65 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  40.08 
 
 		 259 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  37.85 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  37.15 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  38.25 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  39.92 
 
 		 269 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  37.5 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  36.36 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  40.16 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  41.2 
 
 		 273 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  40.77 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  37.89 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  37.89 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  39.69 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  37.89 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  40.16 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  37.89 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  38.34 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  37.89 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  37.89 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  36.51 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  37.89 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  39.13 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  42.8 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  38.25 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  39.53 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  37.8 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  38.76 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  37.55 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  41.11 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  41.34 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  41.11 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  41.11 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  41.34 
 
 		 258 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  41.34 
 
 		 258 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  40.94 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  40.16 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  38.74 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0958  hydroxypyruvate isomerase  37.7 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  38.74 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  38.58 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  38.58 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  38.58 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  38.58 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  39.84 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0949  Hydroxypyruvate isomerase  38.19 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  37.3 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  37.3 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  37.98 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  39.53 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  36.36 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  37.94 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  38.19 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  38.19 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  40.94 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  40.94 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  39.53 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  40.94 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3065  hypothetical protein  40.16 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765519  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3036  hypothetical protein  40.16 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.06 
 
 		 260 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  40.55 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3120  hypothetical protein  40.16 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0148759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2745  AP endonuclease  34.52 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2823  hydroxypyruvate isomerase  34.52 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  40.55 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3104  hypothetical protein  40.16 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  37.8 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1461  AP endonuclease  34.52 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331039  normal  0.325369 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  40.55 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  40.55 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  36.61 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  30.47 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  37.55 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  36.61 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  40.71 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  36.76 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  37.74 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  34.78 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>