More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3391 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  74.89 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  69.41 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  55 
 
 		 285 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  51.57 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  52 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  45.34 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  41.1 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  41.1 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  49.52 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  52.4 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  43.06 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  52.4 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  50.68 
 
 		 261 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.8 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  48.8 
 
 		 233 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  51.44 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  49.5 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.72 
 
 		 224 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.25 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  50.25 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.25 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  43.24 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  48.51 
 
 		 234 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  48.95 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  49.48 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  48.5 
 
 		 232 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  48.5 
 
 		 232 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  49.48 
 
 		 232 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  48.5 
 
 		 691 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  46.61 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  49.48 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  48.5 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  42.97 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  44.34 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.5 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.13 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  45.13 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  47.85 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  48.51 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.24 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.78 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.24 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.75 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  46.63 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.33 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.63 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.81 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.69 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  48.69 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.69 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.38 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.5 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  48.45 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.5 
 
 		 227 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.26 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  41.15 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.34 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.45 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.13 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  42.18 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.2 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  45.02 
 
 		 233 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  48.76 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  51.15 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  37.56 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  37.56 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  43.59 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44 
 
 		 232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  43.59 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 209 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  37.98 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  37.45 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  37.65 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.65 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  44.06 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.41 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.8 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.86 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.56 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.69 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  41.04 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  50 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.63 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.29 
 
 		 198 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  38.5 
 
 		 198 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.32 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.29 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  40.7 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  42.61 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  37.38 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  30.48 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  30.48 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.33 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 357 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.3 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>