More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3380 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  85.03 
 
 
441 aa  708    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  100 
 
 
441 aa  872    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  81.41 
 
 
441 aa  695    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  84.81 
 
 
441 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  84.58 
 
 
441 aa  729    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  82.54 
 
 
441 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  57.5 
 
 
438 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  56.42 
 
 
442 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  56.22 
 
 
448 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  56.22 
 
 
442 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  54.11 
 
 
447 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  55.99 
 
 
442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  55.35 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  53.74 
 
 
438 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  51.72 
 
 
442 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  51.49 
 
 
442 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  55.48 
 
 
447 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  55.56 
 
 
447 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  51.04 
 
 
430 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  54.82 
 
 
447 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  53.51 
 
 
440 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  52.14 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  51.61 
 
 
421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  50.79 
 
 
442 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  51.47 
 
 
442 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  51.59 
 
 
444 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  52.63 
 
 
422 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  49.08 
 
 
423 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  50.57 
 
 
424 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  52.46 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  50.59 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  44.08 
 
 
440 aa  355  6.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 
424 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  48.07 
 
 
437 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  53 
 
 
422 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  45.43 
 
 
467 aa  343  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  47.2 
 
 
432 aa  328  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  47.17 
 
 
397 aa  327  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  48.85 
 
 
437 aa  312  9e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  43.42 
 
 
453 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  39.23 
 
 
429 aa  295  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  39.81 
 
 
434 aa  291  1e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  39.67 
 
 
435 aa  280  3e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  41.76 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  39.07 
 
 
435 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  40.14 
 
 
426 aa  242  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  37.65 
 
 
442 aa  241  2e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.26 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.55 
 
 
425 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  34.6 
 
 
429 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.59 
 
 
427 aa  201  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  35.63 
 
 
428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  34.49 
 
 
412 aa  200  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  33.03 
 
 
457 aa  199  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  34.85 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  35.88 
 
 
443 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  38.05 
 
 
434 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  32.24 
 
 
418 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  32 
 
 
418 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  34.11 
 
 
416 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 
447 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.81 
 
 
422 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  38.83 
 
 
424 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
424 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.59 
 
 
438 aa  193  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.3 
 
 
441 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  32.82 
 
 
441 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.44 
 
 
424 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.06 
 
 
434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.82 
 
 
459 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  41.77 
 
 
386 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.4 
 
 
432 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
424 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  32.44 
 
 
420 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  40.18 
 
 
437 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  41.9 
 
 
448 aa  186  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  35.45 
 
 
424 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  37.76 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.09 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.26 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  37.46 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 
433 aa  183  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  35.88 
 
 
425 aa  182  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  38.66 
 
 
437 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  37.46 
 
 
432 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  37.82 
 
 
381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  37.09 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  37.41 
 
 
435 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.73 
 
 
431 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  37.09 
 
 
436 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  37.09 
 
 
436 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  37.09 
 
 
436 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.9 
 
 
424 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 
425 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  37.16 
 
 
436 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  35.44 
 
 
421 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  37.16 
 
 
435 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  34.69 
 
 
421 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3762  FolC bifunctional protein  41.61 
 
 
435 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 
451 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>