166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3379 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  100 
 
 		 299 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  65.12 
 
 		 277 aa  298  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  60.73 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  63.46 
 
 		 278 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  64.12 
 
 		 276 aa  271  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  57.74 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  60.47 
 
 		 276 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  55.94 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  59.68 
 
 		 288 aa  254  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  60.97 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  58.15 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  58.15 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  55.19 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  55.49 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  54.09 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  55.34 
 
 		 290 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  55.34 
 
 		 290 aa  228  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  55.34 
 
 		 290 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  57.73 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  56.8 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  56.8 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  57.33 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  54.72 
 
 		 287 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  57 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  57 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  56.39 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  56.51 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  56.39 
 
 		 285 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  53.27 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  47 
 
 		 279 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  46.39 
 
 		 274 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  43.89 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  43.89 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  41.56 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  41.53 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  41.53 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  41.72 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  43.49 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  38.41 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  39.22 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  33.88 
 
 		 571 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  38.06 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  33.91 
 
 		 583 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  33.77 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  40.88 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  33.44 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  34.18 
 
 		 244 aa  99.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  33.44 
 
 		 240 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  33.01 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  31.12 
 
 		 255 aa  95.9  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  34.12 
 
 		 248 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  34.75 
 
 		 452 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  37.63 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  34.76 
 
 		 232 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  33.67 
 
 		 250 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  32.12 
 
 		 255 aa  89  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  34.21 
 
 		 453 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  31.4 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  34.36 
 
 		 245 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  38.36 
 
 		 250 aa  85.9  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  31.29 
 
 		 207 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  32.97 
 
 		 577 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.69 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.42 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  30.23 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  35.4 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  32.35 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.31 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  32.56 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  34.05 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  30 
 
 		 570 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  32.16 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  38.79 
 
 		 710 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  28.95 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  29.97 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.92 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.12 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  30.11 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.9 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  29.87 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  32.74 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  29.24 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  31.29 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.97 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  29.77 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  30 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  26.98 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  30 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  31.02 
 
 		 997 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  30.62 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  35.71 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  33.99 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  30.53 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  30.43 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  31.46 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  31.44 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  28.1 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  28.7 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  28 
 
 		 559 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  29.37 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>