211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3085 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  60.07 
 
 
285 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  56.84 
 
 
288 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  53.36 
 
 
295 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.24 
 
 
305 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  54.98 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  53.92 
 
 
297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0646  hypothetical protein  66.2 
 
 
296 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  54.06 
 
 
295 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0657  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.7 
 
 
296 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  53.71 
 
 
295 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  57.37 
 
 
278 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  53.36 
 
 
295 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  52.54 
 
 
305 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2840  hypothetical protein  57.2 
 
 
300 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316251  normal  0.316711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  55.82 
 
 
299 aa  262  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  52.28 
 
 
295 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.88 
 
 
280 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  49.83 
 
 
295 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  53.43 
 
 
314 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  50.88 
 
 
295 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.78 
 
 
291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.615579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  51.64 
 
 
289 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0625  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.22 
 
 
296 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  0.900274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.24 
 
 
285 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  51.64 
 
 
292 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  50 
 
 
295 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  49.64 
 
 
295 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.64 
 
 
295 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  49.64 
 
 
295 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  49.64 
 
 
295 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  49.64 
 
 
299 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  49.64 
 
 
295 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  49.64 
 
 
295 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  49.64 
 
 
295 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  52.81 
 
 
295 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1500  threonine and homoserine efflux system  52.81 
 
 
295 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.6519e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  52.81 
 
 
293 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  47.29 
 
 
293 aa  244  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  51.12 
 
 
320 aa  244  9e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  48.07 
 
 
290 aa  242  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  55.36 
 
 
297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  53.09 
 
 
289 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  53.9 
 
 
283 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  49.82 
 
 
295 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  49.82 
 
 
295 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  50.18 
 
 
295 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  49.09 
 
 
295 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  50.18 
 
 
295 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  48.19 
 
 
295 aa  235  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2390  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.36 
 
 
288 aa  235  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.78 
 
 
282 aa  232  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3928  hypothetical protein  59.77 
 
 
301 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501221  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1483  threonine and homoserine efflux system  51.66 
 
 
295 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  45.59 
 
 
281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0928  threonine and homoserine efflux system  49.09 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.76 
 
 
293 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1197  hypothetical protein  54.06 
 
 
295 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3181  hypothetical protein  48.26 
 
 
281 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  44.09 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2958  hypothetical protein  55.88 
 
 
303 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.675669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  50.57 
 
 
290 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  46.79 
 
 
305 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5800  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.72 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.11 
 
 
305 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  44.41 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1976  hypothetical protein  48.29 
 
 
298 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.487154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.13 
 
 
315 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.77 
 
 
301 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.01 
 
 
296 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2172  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.48 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.85 
 
 
297 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  41.11 
 
 
296 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0975  hypothetical protein  43.17 
 
 
283 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  41.22 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.06 
 
 
325 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1994  putative integral membrane protein  43.85 
 
 
300 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.22 
 
 
303 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  38.02 
 
 
297 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  38.02 
 
 
297 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  38.02 
 
 
297 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.11 
 
 
288 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2218  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.15 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000223898  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7811  hypothetical protein  34.2 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13040  predicted permease, DMT superfamily  46.09 
 
 
293 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0141388  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  36.5 
 
 
301 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  33.7 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.25 
 
 
293 aa  118  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3478  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.89326 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02390  predicted permease, DMT superfamily  41.31 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.857756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1874  hypothetical protein  39.18 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00146807  decreased coverage  0.00345269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.91 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2072  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.45 
 
 
327 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1687  threonine/homoserine efflux transporter  36.54 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3392  hypothetical protein  35.09 
 
 
277 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529802  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34860  predicted permease, DMT superfamily  36.7 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1425  putative integral membrane protein  43.89 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1520  hypothetical protein  35.86 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2007  hypothetical protein  35.46 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.319686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2543  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.9 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  0.409771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>