More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3041 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 691 aa  1349    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  77.74 
 
 		 688 aa  971    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.08 
 
 		 700 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 770 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  43.35 
 
 		 783 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  45.26 
 
 		 772 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 771 aa  177  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 775 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  45.08 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  42.17 
 
 		 497 aa  170  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  40.17 
 
 		 482 aa  168  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4453  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 376 aa  165  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 376 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3782  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 		 377 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 378 aa  161  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 490 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  31.47 
 
 		 463 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  31.47 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 492 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  31.47 
 
 		 492 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  31.47 
 
 		 492 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  31.47 
 
 		 492 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  31.47 
 
 		 492 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  38.39 
 
 		 379 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1667  ATPase domain-containing protein  38.03 
 
 		 384 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  35.45 
 
 		 830 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 662 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1984  histidine kinase  38.03 
 
 		 373 aa  146  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  40.54 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 658 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  31.2 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  39.56 
 
 		 640 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  35.62 
 
 		 388 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3763  Histidine kinase  42.44 
 
 		 394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.597205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  31.27 
 
 		 1226 aa  140  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  37.76 
 
 		 1101 aa  139  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 1229 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 312 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  39.19 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 553 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4713  histidine kinase  40.08 
 
 		 404 aa  134  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.739692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 339 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 370 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  40.08 
 
 		 404 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  40 
 
 		 373 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  36.02 
 
 		 687 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.54 
 
 		 1648 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 448 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.9 
 
 		 391 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  35.16 
 
 		 391 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  36.58 
 
 		 619 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  36.58 
 
 		 680 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 795 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  34.42 
 
 		 392 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  36.53 
 
 		 381 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 795 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  35.54 
 
 		 518 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 671 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  36.19 
 
 		 680 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 366 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 748 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 489 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 359 aa  127  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 640 aa  127  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  33.33 
 
 		 344 aa  127  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 381 aa  127  9e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 		 344 aa  127  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  36.56 
 
 		 467 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 795 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  36.21 
 
 		 381 aa  125  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  36.21 
 
 		 381 aa  125  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 596 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 748 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  33.75 
 
 		 469 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 595 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 484 aa  125  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 644 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4861  histidine kinase  38.33 
 
 		 390 aa  124  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.164786 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  33.65 
 
 		 456 aa  124  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  40.93 
 
 		 740 aa  124  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 459 aa  124  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  31.31 
 
 		 741 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 603 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 665 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  32.17 
 
 		 685 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  33.06 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 799 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  32.41 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 1168 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  36.33 
 
 		 470 aa  122  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 541 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 738 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  36.91 
 
 		 466 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 394 aa  121  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 346 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>