49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2982 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  70.61 
 
 
245 aa  328  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  78.79 
 
 
245 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  68.12 
 
 
234 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  68.5 
 
 
283 aa  289  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  67.53 
 
 
234 aa  275  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  48.89 
 
 
221 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  44.5 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  47.62 
 
 
241 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  47.51 
 
 
238 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  43.54 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  40.77 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  47.65 
 
 
300 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  46.2 
 
 
240 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  47.78 
 
 
246 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  45.51 
 
 
232 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  42.16 
 
 
218 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  43.26 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  40.45 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  37.13 
 
 
238 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  43.43 
 
 
208 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  38.76 
 
 
212 aa  135  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  38.76 
 
 
300 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  39.2 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  38.74 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  105  6e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  35.26 
 
 
182 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  31.52 
 
 
195 aa  93.2  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  32.65 
 
 
195 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  30.61 
 
 
196 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  34.5 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  33.93 
 
 
177 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  36.42 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  30.34 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  30.57 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  30.61 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  28.81 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  30.56 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  32.19 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.7 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  29.07 
 
 
196 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  26.61 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  29.65 
 
 
211 aa  52.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25.32 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  24.46 
 
 
196 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  24.86 
 
 
196 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  28.19 
 
 
199 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  26.67 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  22.17 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>