132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2866 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 229 aa  440  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  74.89 
 
 		 224 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  73.54 
 
 		 238 aa  293  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  73.09 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  74.55 
 
 		 250 aa  268  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  73.36 
 
 		 239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  65 
 
 		 309 aa  248  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  49.77 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  49.77 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  47.49 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  46.12 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  45.41 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  46.36 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  47.58 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  47.14 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  44.55 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  49.09 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  44.09 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  46.64 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  46.36 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  45.06 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  46.82 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  42.73 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  46.36 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  42.27 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  41.74 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  38.84 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  45.87 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  40.91 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  40.45 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  37.99 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  41.82 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  38.39 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  36.44 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  43.24 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  39.07 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  34.07 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  39.45 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  34.07 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  37.61 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  36.71 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  39.42 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  38.05 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  34.96 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  33.93 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  35.74 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  39.38 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  39.38 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  34.06 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  39.38 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  33.78 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  38.81 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  35.65 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  38.36 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  38.5 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  33.59 
 
 		 288 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  34.58 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  36.87 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  30.84 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  38.05 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  37.61 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  37.39 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  35.59 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  32.56 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  33.03 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  37.12 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  37.12 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  37.12 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  37.12 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  37.12 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  37.12 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  31.96 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  37.12 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  34.91 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  34.76 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  38.63 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  38.05 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  31.48 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  40.17 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  37.73 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  34.04 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  34.78 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  40 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  35.32 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  35.32 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  32.61 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  31.86 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  24.65 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  35.4 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  34.1 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  35.43 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  27.39 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  34.98 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  29.58 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  24.44 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  26.98 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  28.39 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  22.07 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  29.25 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  22.22 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>