82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2811 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2811  photosynthetic reaction center subunit M  100 
 
 		 326 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.620792  normal  0.702385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2859  photosynthetic reaction center subunit M  92.26 
 
 		 325 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2964  photosynthetic reaction center subunit M  91.1 
 
 		 325 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.459774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2737  photosynthetic reaction center subunit M  92.11 
 
 		 325 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3704  photosynthetic reaction center subunit M  81.9 
 
 		 326 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0965867  hitchhiker  0.00123144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2059  photosynthetic reaction center subunit M  77.12 
 
 		 321 aa  498  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6430  photosynthetic reaction center subunit M  72.31 
 
 		 308 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1604  photosynthetic reaction center subunit M  69.91 
 
 		 323 aa  447  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.16429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3994  photosynthetic reaction center subunit M  71.1 
 
 		 307 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0754193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1300  photosynthetic reaction center subunit M  71.05 
 
 		 306 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1717  photosynthetic reaction center subunit M  70.45 
 
 		 307 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3749  photosynthetic reaction center subunit M  69.81 
 
 		 307 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.201417  hitchhiker  0.0015702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2974  photosynthetic reaction center subunit M  69.81 
 
 		 306 aa  427  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0172  photosynthetic reaction center subunit M  63.72 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3524  photosynthetic reaction center subunit M  63.49 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157228  normal  0.60913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2029  photosynthetic reaction center subunit M  64.05 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.995154  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1899  photosynthetic reaction center subunit M  64.05 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  0.475655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0256  photosynthetic reaction center subunit M  64.05 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.186945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1640  photosynthetic reaction center subunit M  51.24 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3754  bifunctional photosynthetic reaction center subunit L/M  46.84 
 
 		 641 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0347506  hitchhiker  0.005487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3268  bifunctional photosynthetic reaction center subunit L/M  48.16 
 
 		 643 aa  242  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3750  photosynthetic reaction center subunit L  33.87 
 
 		 277 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279579  hitchhiker  0.00154675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3995  photosynthetic reaction center subunit L  33.87 
 
 		 277 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.118346  normal  0.0163614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1716  photosynthetic reaction center subunit L  33.47 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6431  photosynthetic reaction center subunit L  32.64 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1299  photosynthetic reaction center subunit L  32.8 
 
 		 277 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2812  photosynthetic reaction center subunit L  36.04 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314844  normal  0.517978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1639  photosynthetic reaction center subunit L  32.13 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1605  photosynthetic reaction center subunit L  31.4 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2058  photosynthetic reaction center subunit L  30.17 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167227 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2736  photosynthetic reaction center subunit L  32.64 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3523  photosynthetic reaction center subunit L  32.24 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382012  normal  0.348787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2963  photosynthetic reaction center subunit L  32.64 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.446815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2975  photosynthetic reaction center subunit L  29.07 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2858  photosynthetic reaction center subunit L  32.23 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3703  photosynthetic reaction center subunit L  33.06 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0461593  hitchhiker  0.00115696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0173  photosynthetic reaction center subunit L  33.2 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2030  photosynthetic reaction center subunit L  29.45 
 
 		 282 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1900  photosynthetic reaction center subunit L  30.74 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.142793  normal  0.454885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0257  photosynthetic reaction center subunit L  30.74 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2460  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  26.98 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3553  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  26.98 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3850  photosystem q(b) protein  27.61 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1597  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  26.98 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000196706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2904  photosystem q(b) protein  24.14 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3216  photosystem q(b) protein  24.14 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18681  hypothetical protein  23.45 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.228862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04091  photosystem II PsbA protein (D1)  23.45 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2138  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  28.97 
 
 		 360 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3899  photosystem q(b) protein  27.82 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0661393  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1652  photosystem q(b) protein  28.97 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.390921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0830  photosystem q(b) protein  28.97 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00028698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4763  photosystem q(b) protein  28.97 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0183  photosystem q(b) protein  28.97 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000980824  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0182  photosystem q(b) protein  28.97 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000857268  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1389  photosystem q(b) protein  28.97 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.00000000000163699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0893  photosystem q(b) protein  28.97 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240892  decreased coverage  0.000169599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1498  photosystem q(b) protein  28.04 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1706  photosystem q(b) protein  24.83 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000313247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0767  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  28.57 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0943  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  26.36 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2041  photosystem q(b) protein  28.04 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000221141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1267  photosystem q(b) protein  28.04 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000399793  hitchhiker  0.00458282 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1814  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  28.57 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1817  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  28.57 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2036  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  28.57 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0307  photosystem q(b) protein  28.57 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2293  photosystem q(b) protein  22.76 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1049  photosystem q(b) protein  22.76 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0169  photosystem q(b) protein  22.76 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0452427 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0519  photosystem q(b) protein  28.57 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2016  photosystem q(b) protein  28.04 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1237  photosystem q(b) protein  28.04 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16071  photosystem II PsbD protein (D2)  28.57 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0432746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02461  photosystem II PsbA protein (D1)  22.76 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1042  photosystem q(b) protein  22.76 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1059  photosystem q(b) protein  26.36 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2987  photosystem q(b) protein  26.45 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0424  photosystem q(b) protein  23.45 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1583  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  25.69 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000169219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4121  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  25.25 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0216201 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12331  photosystem II PsbD protein (D2)  28.7 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.153207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>