More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2792 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  100 
 
 
425 aa  855    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  88.84 
 
 
424 aa  699    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  86.85 
 
 
441 aa  692    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  88.59 
 
 
432 aa  691    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  91.34 
 
 
424 aa  710    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  88.83 
 
 
436 aa  692    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  66.9 
 
 
436 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  71.01 
 
 
436 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  66.27 
 
 
436 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  66.27 
 
 
436 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  69.42 
 
 
437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  71.04 
 
 
439 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  69.67 
 
 
437 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  69.42 
 
 
437 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  68.7 
 
 
437 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  65.52 
 
 
429 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  70.05 
 
 
441 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  68.22 
 
 
437 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  66.42 
 
 
430 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  68.56 
 
 
441 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  67.74 
 
 
419 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  73.13 
 
 
446 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  62.29 
 
 
428 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  62.75 
 
 
438 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  57.07 
 
 
431 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  64.02 
 
 
441 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  59.41 
 
 
447 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  63.52 
 
 
441 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  63.52 
 
 
441 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  57.61 
 
 
429 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  57.61 
 
 
429 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  58.92 
 
 
444 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  55.83 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  56.58 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  57.62 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  56.82 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  55.83 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  57.04 
 
 
446 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  62.28 
 
 
428 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  61.86 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  55.56 
 
 
447 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  56.04 
 
 
447 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  55.61 
 
 
439 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  56.87 
 
 
443 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  53.73 
 
 
450 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  57.11 
 
 
443 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  52.25 
 
 
438 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  54.43 
 
 
417 aa  415  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 
429 aa  362  9e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  46.1 
 
 
430 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  46.1 
 
 
430 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  41.22 
 
 
422 aa  325  8.000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  41.91 
 
 
421 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  38.88 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  36.62 
 
 
431 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  32.79 
 
 
430 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.79 
 
 
411 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.58 
 
 
412 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  28.35 
 
 
402 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.58 
 
 
402 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
408 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.32 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  28.44 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  30.07 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  29.5 
 
 
402 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.13 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  27.32 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  27.84 
 
 
402 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  28.03 
 
 
391 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.06 
 
 
402 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  28.84 
 
 
418 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
407 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
425 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
416 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  28.02 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  28.02 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.16 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.16 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.16 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
398 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
407 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  28.53 
 
 
402 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.59 
 
 
408 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.25 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
405 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  26.77 
 
 
400 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  27.12 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  28.37 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  27.65 
 
 
380 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.54 
 
 
419 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  28.65 
 
 
413 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 
458 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  29.44 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  25.31 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  26.89 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>