250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2774 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  71.38 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  66.91 
 
 		 278 aa  346  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  62.35 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  62.35 
 
 		 276 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  61.96 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  61.57 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  57.09 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  59.92 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  54.38 
 
 		 278 aa  258  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  53.73 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  59.55 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  53.82 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  55.89 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  55.56 
 
 		 267 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  57.98 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  53.73 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  58.94 
 
 		 274 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  58.54 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  55.11 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  55.11 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  55.11 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  53.87 
 
 		 286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  48.69 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  53.17 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  51.16 
 
 		 278 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  50 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  50 
 
 		 281 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  54.01 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  50.38 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  49.43 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  45.99 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  44.24 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  53.79 
 
 		 286 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  46.62 
 
 		 280 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  55.3 
 
 		 286 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  48.09 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  47.76 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  47.73 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  47.1 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  43.49 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  43.56 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  48.45 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  46.59 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  44.19 
 
 		 276 aa  175  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.08 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  44.32 
 
 		 276 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  39.83 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.46 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  28.2 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  38.43 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  26.64 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  37.31 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  37.11 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  34.8 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.23 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  34.65 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  33.19 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  33.19 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.7 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  32.91 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  38.66 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  32.77 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  36.48 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  32.77 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  37.45 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  31.73 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  37.13 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  24.6 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  33.58 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  29.04 
 
 		 269 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  26.15 
 
 		 289 aa  88.6  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  31.32 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  28.76 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  34.9 
 
 		 253 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  34.26 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  33.91 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  32.59 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  29.96 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  36.32 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  32.42 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  32.42 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  35.32 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  34.69 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  32.42 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  29.5 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  28.45 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  33.19 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  34.92 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  33.77 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  30.11 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  32.66 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  36.11 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  28.11 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  28.11 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  30.28 
 
 		 302 aa  72  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  30.35 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  29.8 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>