45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2737 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  62.77 
 
 
328 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  62.15 
 
 
328 aa  345  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  63.9 
 
 
328 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  55.82 
 
 
334 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  41.25 
 
 
365 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  41.61 
 
 
326 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  40.4 
 
 
322 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  43.64 
 
 
328 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  42.44 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  41.99 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  33.54 
 
 
329 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  41.25 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  34.86 
 
 
329 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  36.78 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  34.44 
 
 
244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  32.33 
 
 
258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  35.25 
 
 
246 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  32.93 
 
 
258 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  30.77 
 
 
256 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  30.45 
 
 
256 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  31.8 
 
 
264 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  32.92 
 
 
249 aa  97.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  33.91 
 
 
232 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  64.81 
 
 
336 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.421494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  33.76 
 
 
245 aa  95.5  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  28.63 
 
 
253 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  33.2 
 
 
237 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  29.61 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  27.31 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  24.47 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  31.25 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  29.31 
 
 
241 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  29 
 
 
270 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  30.57 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  35.16 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  29.22 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  28.11 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  28.38 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  29.32 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  27.74 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  34.95 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>