52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2727 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  100 
 
 		 177 aa  358  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  60 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  57.95 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  60.38 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  60.38 
 
 		 176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  56.82 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  56.25 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  54.65 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  54.55 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  52.83 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  48.91 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  54.14 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  48 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  41.01 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  42.95 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  42.31 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  45.06 
 
 		 173 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  42.68 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  44.51 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  40.85 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  40.99 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  40 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  40.65 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  39.13 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  40.67 
 
 		 185 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  32.02 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  35.67 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  38.41 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  32.35 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  37.13 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  34.56 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  27.53 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  35.45 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  28.47 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  37.61 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  36.54 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  34.53 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  31.17 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  32.08 
 
 		 136 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  27.81 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  30.25 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  30.25 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  31.34 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  23.49 
 
 		 138 aa  47.8  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  26.62 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  34.26 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  29.07 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  26.44 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  26.36 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  40.8  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  28.07 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>