284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2703 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  70.38 
 
 		 259 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  75.32 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  75.55 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  72.61 
 
 		 257 aa  343  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  68.15 
 
 		 257 aa  340  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  50.19 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  50.19 
 
 		 255 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  49.04 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  50.57 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  51.29 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  49.04 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  45.64 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  46.03 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  46.43 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  52.44 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  49.4 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  41.7 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  39.53 
 
 		 274 aa  194  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  41.63 
 
 		 252 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  42.29 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  39.02 
 
 		 265 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  39.02 
 
 		 265 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  42.4 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  43.33 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  40.41 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  39.22 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  38.03 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  39.22 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  38.75 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  38.75 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  39.46 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  39.46 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  39.09 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.18 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  35.27 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  35.11 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  39.57 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  33.05 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  37.64 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  40.88 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  35.47 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  29.03 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  34.48 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  34.55 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  36.57 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  33.92 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  37.65 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  35.22 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  37.8 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  35.74 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  34.66 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  32.6 
 
 		 211 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  31.06 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 535 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  26.56 
 
 		 294 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  33.13 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  26.56 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  26.56 
 
 		 294 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  34.76 
 
 		 198 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.9 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.9 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 204 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 210 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  26.94 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  29.41 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.95 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  29.76 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.95 
 
 		 354 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  29.33 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  29.76 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  29.76 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>