35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2698 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  76.09 
 
 
180 aa  230  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  76.81 
 
 
187 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  61 
 
 
198 aa  228  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  73.91 
 
 
198 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  75 
 
 
198 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  47.45 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  37.24 
 
 
191 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  42.42 
 
 
181 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  30.22 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  30.53 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  28.78 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  29.79 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  28.78 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  32.99 
 
 
169 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  31.96 
 
 
169 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  35.71 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  35.71 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  29.6 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  29.6 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  31.5 
 
 
178 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  34.52 
 
 
184 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  30.08 
 
 
180 aa  51.2  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  25.19 
 
 
180 aa  48.9  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  26.81 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  25.93 
 
 
201 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  25.45 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  26.09 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  39.68 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  44.19 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  28.99 
 
 
140 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  24.69 
 
 
159 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  36.51 
 
 
182 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>