232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2690 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  100 
 
 
458 aa  881    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  68.84 
 
 
450 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  66.35 
 
 
442 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  66.35 
 
 
442 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  70.42 
 
 
457 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  69.47 
 
 
434 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  31.97 
 
 
463 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  35.6 
 
 
474 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  34.62 
 
 
476 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  33.57 
 
 
480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  35.11 
 
 
415 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  33.08 
 
 
425 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  34.16 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  34.2 
 
 
435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  27.71 
 
 
436 aa  129  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  31.82 
 
 
414 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  32.49 
 
 
422 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  31.39 
 
 
485 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  31.91 
 
 
450 aa  126  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  34.05 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  31.18 
 
 
409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  33.92 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  33.33 
 
 
445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  32.71 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  26.05 
 
 
495 aa  117  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  29.52 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  33.17 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  25.83 
 
 
495 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  32.12 
 
 
422 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  32.67 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  32.38 
 
 
504 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  32.96 
 
 
463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  31.26 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  31.2 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  28.54 
 
 
445 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  36.06 
 
 
439 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  32.51 
 
 
430 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  32.64 
 
 
476 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  31.85 
 
 
424 aa  103  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  30.05 
 
 
466 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  31.93 
 
 
419 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  31.81 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  28.71 
 
 
481 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  30.17 
 
 
657 aa  96.7  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  31.08 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  32.05 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  27.59 
 
 
479 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  27.99 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  26.97 
 
 
433 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  33.58 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  28.96 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  30.11 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  24.47 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  32.49 
 
 
407 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  28.64 
 
 
468 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  24.78 
 
 
536 aa  74.3  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  27.78 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  25.53 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  28.34 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  28.96 
 
 
1199 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  23.53 
 
 
494 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  30.04 
 
 
463 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  29.88 
 
 
426 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  26.97 
 
 
498 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  30.63 
 
 
429 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  56.36 
 
 
537 aa  60.8  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  30.25 
 
 
418 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  54.55 
 
 
462 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  28.07 
 
 
443 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.98 
 
 
435 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  54.55 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  38.81 
 
 
492 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  27.42 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  30.43 
 
 
436 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  23.91 
 
 
469 aa  57  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  28.44 
 
 
451 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  50 
 
 
450 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  50 
 
 
450 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  46.43 
 
 
464 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  25.64 
 
 
600 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  52.63 
 
 
543 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  27.07 
 
 
484 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  29.03 
 
 
498 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  42.35 
 
 
492 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  29.03 
 
 
498 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  31.25 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  27.62 
 
 
492 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  22.17 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  26.62 
 
 
452 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  48.28 
 
 
457 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  22.89 
 
 
628 aa  53.5  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  55.36 
 
 
459 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  28.03 
 
 
408 aa  53.5  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  50.91 
 
 
456 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  54.39 
 
 
419 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  50 
 
 
510 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  53.45 
 
 
456 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  24.83 
 
 
480 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  23.32 
 
 
477 aa  53.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>