More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2610 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  100 
 
 
371 aa  732    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  83.15 
 
 
371 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  61.66 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  62.4 
 
 
389 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  55.85 
 
 
389 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  48.46 
 
 
402 aa  352  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  52.31 
 
 
394 aa  338  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  51.05 
 
 
396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  50.26 
 
 
398 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  52.69 
 
 
401 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  50.89 
 
 
398 aa  329  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  48.21 
 
 
400 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  48.46 
 
 
411 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  51.06 
 
 
390 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  51.67 
 
 
400 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  49.37 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  49.74 
 
 
401 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  49.11 
 
 
402 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  48.02 
 
 
393 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  47.24 
 
 
392 aa  316  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  50.66 
 
 
404 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  49.08 
 
 
396 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  48.96 
 
 
400 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  46.53 
 
 
405 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  47.26 
 
 
390 aa  308  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  47.14 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  45.26 
 
 
404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  47.45 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  47.99 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  47.18 
 
 
396 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  47.95 
 
 
403 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  46.55 
 
 
393 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  47.4 
 
 
410 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  48.02 
 
 
402 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  46.07 
 
 
393 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  47.49 
 
 
394 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  48.58 
 
 
405 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  45.48 
 
 
397 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  46.13 
 
 
392 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  47.21 
 
 
395 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  45.04 
 
 
399 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  44.44 
 
 
404 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  49.47 
 
 
399 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  43.57 
 
 
403 aa  296  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  46.98 
 
 
412 aa  296  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  44.72 
 
 
397 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  47.55 
 
 
416 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  48.94 
 
 
399 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  47.89 
 
 
400 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  46.28 
 
 
393 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  46.28 
 
 
393 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  45.45 
 
 
407 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  46.46 
 
 
392 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  46.72 
 
 
402 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  46.19 
 
 
392 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  46.46 
 
 
392 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  46.46 
 
 
392 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  44.53 
 
 
408 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  42.74 
 
 
399 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  46.19 
 
 
392 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  46.19 
 
 
392 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  45.96 
 
 
405 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  46.19 
 
 
392 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  47.59 
 
 
1305 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  50.13 
 
 
1230 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  47.76 
 
 
402 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  47.76 
 
 
402 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  43.98 
 
 
382 aa  281  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  45.26 
 
 
396 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  45.53 
 
 
392 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  44.76 
 
 
391 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  46.19 
 
 
391 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  49.35 
 
 
1230 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  45.85 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  44.44 
 
 
391 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  41.32 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  47.11 
 
 
400 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  41.16 
 
 
401 aa  272  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  39.9 
 
 
394 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  47.67 
 
 
1228 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  44.91 
 
 
397 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  40.37 
 
 
408 aa  269  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  43.44 
 
 
407 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  42.42 
 
 
412 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  39.19 
 
 
404 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  50.65 
 
 
385 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  39.59 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  42.19 
 
 
392 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  39.48 
 
 
397 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  42.48 
 
 
397 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  45.13 
 
 
413 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  39.19 
 
 
404 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  40.52 
 
 
396 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  40.67 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5006  hypothetical protein  44.12 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.9079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  41.18 
 
 
394 aa  252  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  41.77 
 
 
392 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  38.96 
 
 
397 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  38.96 
 
 
397 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  37.11 
 
 
399 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>