More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2578 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  81.96 
 
 
526 aa  827    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
527 aa  1063    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  79.95 
 
 
524 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  64.42 
 
 
519 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  62.12 
 
 
513 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.64 
 
 
512 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.03 
 
 
515 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  58.62 
 
 
512 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.15 
 
 
508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.14 
 
 
510 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.6 
 
 
630 aa  508  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.51 
 
 
503 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.4 
 
 
494 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  51.96 
 
 
511 aa  500  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.02 
 
 
513 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.76 
 
 
501 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.37 
 
 
510 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  61.42 
 
 
457 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.53 
 
 
634 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  61.75 
 
 
534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  62.8 
 
 
500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.59 
 
 
515 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2345  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.64 
 
 
509 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.43 
 
 
514 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  61.06 
 
 
501 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
631 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 
608 aa  345  8e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 
379 aa  343  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 
398 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
851 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
692 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.04 
 
 
461 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3152  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.63 
 
 
473 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285761  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.61 
 
 
471 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.39 
 
 
472 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.816658  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  31.14 
 
 
1255 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
673 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
632 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  30.52 
 
 
823 aa  214  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
773 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
680 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
1000 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
708 aa  200  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
902 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
1291 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
799 aa  193  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
662 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
763 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
553 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0909  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
661 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2568  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
661 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.957334  normal  0.86605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2452  multisensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
556 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
695 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.24 
 
 
393 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1718  PAS sensor protein  27.81 
 
 
811 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.604616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
845 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 
748 aa  183  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
683 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  27.04 
 
 
1629 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
874 aa  180  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0244  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
661 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.78 
 
 
363 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
710 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09680  putative two-component sensor  32.06 
 
 
758 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280017  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
848 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
652 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
1211 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2126  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
848 aa  177  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
499 aa  177  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
697 aa  177  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
689 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
707 aa  176  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
698 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
729 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3366  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
716 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
666 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
1211 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  29.57 
 
 
812 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
779 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
857 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.897717  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.66 
 
 
857 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0644  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
487 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
848 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
759 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
857 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4016  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
716 aa  170  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
733 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
975 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
875 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.39 
 
 
1845 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
862 aa  167  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508108  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
636 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
856 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00464627  hitchhiker  0.00534062 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  27.06 
 
 
846 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
963 aa  166  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  27.4 
 
 
835 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  27.4 
 
 
835 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
640 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
978 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  27.4 
 
 
835 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>