More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2473 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  85.04 
 
 		 240 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  83.76 
 
 		 241 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.76 
 
 		 241 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  74.69 
 
 		 241 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.83 
 
 		 251 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  64.83 
 
 		 246 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  64.53 
 
 		 240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.45 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  60.59 
 
 		 249 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  53.75 
 
 		 245 aa  268  4e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  56.03 
 
 		 236 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  53.75 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.93 
 
 		 239 aa  261  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.44 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  52.55 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  53.56 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.52 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  52.16 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  50.62 
 
 		 241 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  56.36 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  53.71 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.88 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  51.45 
 
 		 243 aa  238  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  51.91 
 
 		 247 aa  238  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  51.5 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  52.77 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.06 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  53.62 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  51.91 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  51.91 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.56 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  51.91 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  51.95 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  50.65 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  49.14 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.06 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.41 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.28 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  51.88 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.22 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 239 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 		 245 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  52.79 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  52.79 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.37 
 
 		 239 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  48.1 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 242 aa  224  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  52.47 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  51.93 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 245 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  48.74 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  47.86 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 245 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  48.5 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  50.64 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  47.39 
 
 		 238 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  49.36 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 241 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  48.5 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  50.21 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  51.71 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 241 aa  214  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 241 aa  214  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  48.93 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  49.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  48.75 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  48.51 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  49.35 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  48.5 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  46.96 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  48.5 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  48.5 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  45.96 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 245 aa  211  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  48.5 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  48.93 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.36 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.62 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  48.29 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>