More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2394 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  66.6 
 
 
520 aa  698    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  68.69 
 
 
526 aa  698    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
547 aa  1131    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  56.7 
 
 
534 aa  581  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.41 
 
 
524 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  48.39 
 
 
528 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.58 
 
 
516 aa  468  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.22 
 
 
518 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.89 
 
 
524 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.88 
 
 
534 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.88 
 
 
534 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.66 
 
 
534 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.82 
 
 
506 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  44.26 
 
 
521 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.26 
 
 
534 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
510 aa  389  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  46.67 
 
 
502 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.97 
 
 
506 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.12 
 
 
512 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.7 
 
 
512 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  42.23 
 
 
506 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.89 
 
 
501 aa  358  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.92 
 
 
494 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  40.04 
 
 
494 aa  342  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  41.23 
 
 
489 aa  330  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  35.04 
 
 
522 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  35.67 
 
 
502 aa  295  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.7 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.86 
 
 
504 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.56 
 
 
563 aa  196  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.39 
 
 
532 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.81 
 
 
561 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.2 
 
 
572 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.74 
 
 
545 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  27.64 
 
 
573 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.95 
 
 
531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.42 
 
 
550 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.42 
 
 
544 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.75 
 
 
549 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.35 
 
 
572 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.52 
 
 
527 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.99 
 
 
553 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.55 
 
 
522 aa  143  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.55 
 
 
522 aa  143  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27.7 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  26.98 
 
 
549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.85 
 
 
522 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.79 
 
 
563 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 
566 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.76 
 
 
570 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.19 
 
 
698 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.3 
 
 
540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  26.43 
 
 
558 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  26.09 
 
 
528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.22 
 
 
527 aa  133  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.84 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.21 
 
 
553 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.17 
 
 
578 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.5 
 
 
570 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.94 
 
 
570 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.81 
 
 
528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.19 
 
 
539 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  24.69 
 
 
551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.04 
 
 
582 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  24.4 
 
 
561 aa  128  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  28.28 
 
 
480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.32 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.21 
 
 
573 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  28.28 
 
 
483 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.76 
 
 
545 aa  127  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33650  dehydrogenase flavoprotein subunit  25.13 
 
 
596 aa  126  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.35 
 
 
563 aa  126  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.84 
 
 
548 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 
567 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.65 
 
 
550 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.45 
 
 
539 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.45 
 
 
539 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.45 
 
 
539 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.46 
 
 
559 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.71 
 
 
755 aa  124  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.8 
 
 
560 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  25.89 
 
 
539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.21 
 
 
526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.35 
 
 
566 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  28.05 
 
 
549 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.78 
 
 
522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.64 
 
 
522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.94 
 
 
561 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.23 
 
 
534 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  27.94 
 
 
547 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.1 
 
 
565 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  25.96 
 
 
523 aa  120  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.38 
 
 
569 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.45 
 
 
547 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.63 
 
 
547 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.27 
 
 
561 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  29.11 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  29.11 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  24.74 
 
 
565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  29.11 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>