More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2384 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
364 aa  709    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  79.03 
 
 
377 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  78.73 
 
 
366 aa  484  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  79.12 
 
 
367 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  77.45 
 
 
375 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  78.18 
 
 
366 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  59.95 
 
 
408 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  58.2 
 
 
387 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  59.83 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.37 
 
 
386 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  51.82 
 
 
390 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  50.66 
 
 
391 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  53.49 
 
 
382 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  49.87 
 
 
394 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  52.66 
 
 
382 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  49.09 
 
 
395 aa  342  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  50 
 
 
366 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  50.3 
 
 
470 aa  297  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  46.28 
 
 
350 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  45.62 
 
 
335 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  45.24 
 
 
338 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  42.45 
 
 
419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.55 
 
 
335 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  47.96 
 
 
335 aa  252  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  42.11 
 
 
377 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  41.9 
 
 
417 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  43.06 
 
 
349 aa  248  8e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  43.98 
 
 
328 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  43.47 
 
 
337 aa  242  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  43.77 
 
 
361 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  41.62 
 
 
372 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  43.1 
 
 
366 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  44.25 
 
 
407 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  44.31 
 
 
345 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  40.43 
 
 
340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  39.37 
 
 
364 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  38.36 
 
 
420 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  42.51 
 
 
334 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  42.04 
 
 
337 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  39.44 
 
 
328 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  40.12 
 
 
331 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  38.08 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  38.25 
 
 
320 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  38.74 
 
 
320 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  37.28 
 
 
350 aa  190  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  38.08 
 
 
326 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  35.65 
 
 
394 aa  187  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  37.1 
 
 
359 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.52 
 
 
355 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.56 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  38.55 
 
 
343 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  35.41 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  35.22 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  36.53 
 
 
323 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  36.67 
 
 
320 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.97 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.8 
 
 
323 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  36.39 
 
 
329 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  34.12 
 
 
353 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  37.2 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  37.2 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.17 
 
 
345 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  36.34 
 
 
353 aa  179  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  35.34 
 
 
362 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  36.36 
 
 
360 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.05 
 
 
347 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  41.23 
 
 
326 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  36.78 
 
 
324 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  33.92 
 
 
352 aa  176  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.58 
 
 
355 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  35.65 
 
 
367 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 
350 aa  176  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  37.24 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  37.5 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.13 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  34.65 
 
 
358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  35.89 
 
 
323 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  46.19 
 
 
362 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  34.97 
 
 
332 aa  169  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  35.75 
 
 
354 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  33.53 
 
 
357 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  35.2 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  47.03 
 
 
363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  31.61 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  32 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32 
 
 
316 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.72 
 
 
319 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.91 
 
 
316 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32 
 
 
316 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  31.72 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.2 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.69 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  34.15 
 
 
343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  37.22 
 
 
322 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.61 
 
 
316 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  32.16 
 
 
362 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  33.62 
 
 
347 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  35.82 
 
 
339 aa  162  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>