212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2304 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  54.26 
 
 		 619 aa  646    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  53.05 
 
 		 605 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  58.36 
 
 		 610 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  55.76 
 
 		 596 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  52.68 
 
 		 605 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  54.89 
 
 		 602 aa  636    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  54.92 
 
 		 616 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  77.06 
 
 		 619 aa  961    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  55.78 
 
 		 609 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  58.36 
 
 		 610 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  55.87 
 
 		 609 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  56.63 
 
 		 665 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  77.23 
 
 		 619 aa  961    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  52.77 
 
 		 623 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  55.9 
 
 		 626 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  71.13 
 
 		 613 aa  881    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  55.28 
 
 		 609 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  56.28 
 
 		 611 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  55.45 
 
 		 609 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  54.89 
 
 		 602 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  75.95 
 
 		 620 aa  947    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  55.97 
 
 		 626 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  58.36 
 
 		 610 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  52.77 
 
 		 623 aa  655    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  58.36 
 
 		 610 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  58.36 
 
 		 610 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  58.36 
 
 		 610 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  58.36 
 
 		 610 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 629 aa  1283    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  70.77 
 
 		 608 aa  886    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  55.45 
 
 		 609 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  55.87 
 
 		 609 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  53 
 
 		 600 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  55.42 
 
 		 600 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  54.4 
 
 		 611 aa  631  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  52.61 
 
 		 617 aa  625  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  52.45 
 
 		 593 aa  618  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  51.92 
 
 		 601 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  54.92 
 
 		 597 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  54.27 
 
 		 598 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  53.33 
 
 		 596 aa  615  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  50.49 
 
 		 602 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  53.85 
 
 		 586 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  51.52 
 
 		 598 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  53.38 
 
 		 594 aa  610  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  51.51 
 
 		 597 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  51.88 
 
 		 614 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  51.85 
 
 		 598 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  52.54 
 
 		 629 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  50.92 
 
 		 598 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  50.59 
 
 		 626 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  52.21 
 
 		 628 aa  599  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  50.57 
 
 		 601 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  51.6 
 
 		 601 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  52.05 
 
 		 602 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  52.73 
 
 		 603 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  50.57 
 
 		 627 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  52.12 
 
 		 610 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  50 
 
 		 629 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  53.85 
 
 		 602 aa  586  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  51.68 
 
 		 601 aa  582  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  53.37 
 
 		 600 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  51.93 
 
 		 599 aa  581  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  50.84 
 
 		 605 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  50.83 
 
 		 627 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  53.73 
 
 		 727 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  49.83 
 
 		 602 aa  559  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  46.29 
 
 		 850 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  47.4 
 
 		 589 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  45.21 
 
 		 596 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  46.93 
 
 		 643 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  45.44 
 
 		 605 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  45.07 
 
 		 596 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  46.01 
 
 		 629 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  44.75 
 
 		 604 aa  464  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  44.63 
 
 		 592 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  44.63 
 
 		 592 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  43.63 
 
 		 593 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  41.34 
 
 		 639 aa  445  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  43.47 
 
 		 636 aa  445  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  39.07 
 
 		 632 aa  423  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  39.4 
 
 		 608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  39.49 
 
 		 608 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  38.61 
 
 		 612 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  38.37 
 
 		 612 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  39.59 
 
 		 679 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  41.18 
 
 		 595 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.97 
 
 		 613 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  40.07 
 
 		 610 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  39.3 
 
 		 627 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  38.03 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  36.94 
 
 		 612 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  38.83 
 
 		 625 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  40.71 
 
 		 635 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  38.63 
 
 		 599 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  35.86 
 
 		 606 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  39.4 
 
 		 607 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  39.03 
 
 		 672 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  37.42 
 
 		 894 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  36.27 
 
 		 599 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>